More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0035 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
478 aa  962    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  86.61 
 
 
478 aa  863    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  86.61 
 
 
478 aa  863    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  72.35 
 
 
480 aa  718    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  84.1 
 
 
478 aa  836    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  80.83 
 
 
481 aa  806    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  73.62 
 
 
490 aa  744    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  80.17 
 
 
479 aa  793    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  87.89 
 
 
479 aa  868    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  79.96 
 
 
479 aa  796    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  67.03 
 
 
482 aa  614  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  54.49 
 
 
515 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  54.24 
 
 
530 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  54.94 
 
 
549 aa  511  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  54.53 
 
 
538 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  54.32 
 
 
550 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  53.37 
 
 
522 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  53.73 
 
 
521 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  54.94 
 
 
535 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  53.73 
 
 
524 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  53.73 
 
 
530 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  53.73 
 
 
524 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  54.73 
 
 
532 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  53.73 
 
 
524 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  53.73 
 
 
530 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  52.76 
 
 
526 aa  501  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  53.44 
 
 
515 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  53.73 
 
 
524 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  53.44 
 
 
515 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  53.73 
 
 
524 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  53.44 
 
 
515 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  53.47 
 
 
511 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  53.44 
 
 
515 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  53.14 
 
 
513 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  52.98 
 
 
477 aa  489  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  51.16 
 
 
481 aa  489  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  52.77 
 
 
477 aa  481  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  52.07 
 
 
480 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  50.63 
 
 
476 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  51.74 
 
 
483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  51.33 
 
 
468 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  46.32 
 
 
439 aa  388  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  43.71 
 
 
432 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  44.13 
 
 
441 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  45.15 
 
 
428 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  46.91 
 
 
426 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  47.26 
 
 
436 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  47.03 
 
 
436 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  45.56 
 
 
444 aa  358  9e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  48.56 
 
 
444 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  46.51 
 
 
438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  45.41 
 
 
438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  46.15 
 
 
438 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  46.15 
 
 
438 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  43.4 
 
 
443 aa  351  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  44.01 
 
 
439 aa  351  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  45.08 
 
 
444 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  44.23 
 
 
455 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  44.72 
 
 
437 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  47.21 
 
 
450 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  45.27 
 
 
445 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  44.33 
 
 
440 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  43.74 
 
 
445 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  43.74 
 
 
445 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  44.6 
 
 
439 aa  347  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  44.37 
 
 
443 aa  343  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  42 
 
 
452 aa  343  4e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  43.85 
 
 
439 aa  338  9e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  43.28 
 
 
468 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  47.34 
 
 
457 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  47.33 
 
 
482 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  47.33 
 
 
482 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  45.27 
 
 
445 aa  332  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  40.65 
 
 
462 aa  329  6e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  44.87 
 
 
458 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  40.13 
 
 
446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  44.32 
 
 
441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  47.31 
 
 
423 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  48.99 
 
 
415 aa  326  7e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  44.84 
 
 
451 aa  325  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  45.82 
 
 
456 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  46.08 
 
 
457 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  44.5 
 
 
444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  42.52 
 
 
461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  45.76 
 
 
451 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  40.58 
 
 
456 aa  319  6e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  40.37 
 
 
456 aa  319  6e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  46.27 
 
 
440 aa  319  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  46.27 
 
 
440 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  45.24 
 
 
447 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  46.42 
 
 
440 aa  316  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  46.42 
 
 
440 aa  316  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  46.19 
 
 
446 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  42.86 
 
 
445 aa  314  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  45.93 
 
 
440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  42.4 
 
 
438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  47.3 
 
 
452 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  46.26 
 
 
458 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  46.93 
 
 
444 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  46.72 
 
 
453 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>