More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1338 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 377 aa  750    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4480  aminotransferase  46.51 
 
 		 386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  27.62 
 
 		 404 aa  146  6e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.45 
 
 		 377 aa  145  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  27.95 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  27.74 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  30.42 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  30.97 
 
 		 368 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  31.76 
 
 		 379 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  28.39 
 
 		 383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  27.9 
 
 		 409 aa  129  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  29.02 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  31.25 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  31.13 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  26.77 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  25.53 
 
 		 369 aa  122  8e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  31.63 
 
 		 393 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  27.25 
 
 		 362 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  29.3 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  27.76 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  35.98 
 
 		 396 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  25.21 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  35 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  24.5 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  34.72 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  34.92 
 
 		 396 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  26.47 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  25.35 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  25.32 
 
 		 374 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  25.35 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  34.59 
 
 		 409 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  32.98 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  30.77 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  34.39 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  30.17 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  29.37 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  28.74 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  23.41 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  23.79 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  29.1 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  32.26 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  35.04 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  33.94 
 
 		 396 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  32.46 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2069  aminotransferase, class I and II  36.22 
 
 		 375 aa  99.8  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.708727 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  24.17 
 
 		 456 aa  99.8  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  31.58 
 
 		 392 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  31.62 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  28.42 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  31.23 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2062  aminotransferase class I and II  30.99 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  25.28 
 
 		 411 aa  97.8  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  24.42 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1518  aminotransferase class I and II  31.17 
 
 		 374 aa  97.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  34.67 
 
 		 385 aa  97.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  33.62 
 
 		 385 aa  97.1  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  26.03 
 
 		 400 aa  96.7  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07891  aspartate aminotransferase  25.81 
 
 		 409 aa  96.3  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  31.51 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  26.5 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  29.96 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  28.94 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  29.19 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2271  aspartate aminotransferase  27.22 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.738688  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  30.37 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  26.03 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0178  aminotransferase class I and II  30.69 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  33.46 
 
 		 421 aa  94  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  28.63 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  27.71 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  35.29 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0372  2-aminoadipate aminotransferase / aromatic amino acid aminotransferase  25 
 
 		 411 aa  94  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3433  hypothetical protein  26.28 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  29.76 
 
 		 399 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  27.71 
 
 		 388 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  31.08 
 
 		 393 aa  93.6  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  31.97 
 
 		 392 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  26.91 
 
 		 387 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  32.07 
 
 		 394 aa  93.2  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1077  histidinol-phosphate aminotransferase  32.46 
 
 		 369 aa  93.2  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  27.65 
 
 		 400 aa  92.8  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  25 
 
 		 393 aa  93.2  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  26.64 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  25.23 
 
 		 396 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  23.24 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  24.35 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  27.24 
 
 		 406 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  30.19 
 
 		 397 aa  92  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  24.75 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  31.6 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  29.48 
 
 		 401 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  31.6 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  32.56 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  32.62 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  28.78 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  32.8 
 
 		 396 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0549  aminotransferase class I and II  26.52 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  35.35 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  29.78 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  31.13 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>