More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0372 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0372  2-aminoadipate aminotransferase / aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 
411 aa  845    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
395 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  33.25 
 
 
395 aa  249  6e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
395 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
395 aa  247  3e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 
400 aa  228  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
383 aa  227  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 
611 aa  226  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  32.24 
 
 
397 aa  224  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 
437 aa  222  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  32.45 
 
 
436 aa  222  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  33.69 
 
 
436 aa  222  8e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 
438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  32.32 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 
430 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 
446 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  30.87 
 
 
405 aa  219  5e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  32.48 
 
 
440 aa  219  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  34.35 
 
 
417 aa  216  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
416 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  31.81 
 
 
438 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  30.95 
 
 
439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 
440 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 
414 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  30.56 
 
 
437 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
437 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  32.91 
 
 
406 aa  209  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  32.49 
 
 
404 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  31.87 
 
 
433 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 
396 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
399 aa  206  5e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  30.94 
 
 
401 aa  206  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 
396 aa  206  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 
397 aa  206  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 
396 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
406 aa  206  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 
463 aa  206  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  32.19 
 
 
420 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
441 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 
401 aa  204  3e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  33.6 
 
 
402 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
340 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
397 aa  203  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 
426 aa  202  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  33.6 
 
 
402 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  30.6 
 
 
416 aa  202  7e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
386 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
393 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  32.35 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
393 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 
454 aa  199  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
399 aa  199  7e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
396 aa  199  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
450 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  30.34 
 
 
433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 
435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0771  GntR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 
416 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  30.65 
 
 
393 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  30.56 
 
 
399 aa  197  3e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 
395 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 
554 aa  197  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
477 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 
403 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
398 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 
394 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
477 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  29.31 
 
 
477 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
477 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  31.66 
 
 
393 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  30.71 
 
 
397 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.31 
 
 
477 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 
398 aa  196  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  30.15 
 
 
393 aa  196  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
393 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  30.15 
 
 
393 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
407 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.31 
 
 
477 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
477 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  29.31 
 
 
477 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
398 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 
398 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
398 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
394 aa  193  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 
425 aa  193  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  30.36 
 
 
398 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
393 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.53 
 
 
477 aa  192  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.39 
 
 
490 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  29.9 
 
 
393 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  29.9 
 
 
393 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
397 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
414 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.68 
 
 
477 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
403 aa  191  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>