124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06254 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  100 
 
 		 431 aa  889    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  42.06 
 
 		 1271 aa  322  9.000000000000001e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  36.52 
 
 		 868 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  36.52 
 
 		 868 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  35.85 
 
 		 868 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  35.56 
 
 		 863 aa  253  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  36.28 
 
 		 868 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  35.68 
 
 		 868 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  35.8 
 
 		 867 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  34.44 
 
 		 869 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  33.33 
 
 		 848 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  34.35 
 
 		 563 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  34.23 
 
 		 855 aa  234  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  33.56 
 
 		 848 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  33.81 
 
 		 868 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  33.72 
 
 		 972 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  33.18 
 
 		 484 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  32.49 
 
 		 674 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  36.36 
 
 		 373 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  31.36 
 
 		 674 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  31.36 
 
 		 674 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  31.36 
 
 		 674 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  31.36 
 
 		 674 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  31.36 
 
 		 674 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  32.3 
 
 		 674 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  29.62 
 
 		 639 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  31.21 
 
 		 674 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  31.87 
 
 		 674 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  31.72 
 
 		 674 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  31.86 
 
 		 674 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  30.39 
 
 		 372 aa  176  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  34.01 
 
 		 377 aa  176  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  31.08 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  35.65 
 
 		 401 aa  174  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  34.55 
 
 		 364 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1080 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  32.4 
 
 		 382 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  29.47 
 
 		 451 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  28.27 
 
 		 1051 aa  151  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  28.31 
 
 		 1053 aa  149  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 		 1129 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 		 652 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  29.3 
 
 		 652 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  31.65 
 
 		 651 aa  146  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  28.66 
 
 		 997 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  31.28 
 
 		 703 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  31.78 
 
 		 388 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  26.3 
 
 		 439 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  31.91 
 
 		 792 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  32.37 
 
 		 539 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  27.97 
 
 		 772 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  26.6 
 
 		 1146 aa  140  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  28.86 
 
 		 396 aa  139  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  27.39 
 
 		 1054 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  32.13 
 
 		 540 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  25.56 
 
 		 760 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  25.79 
 
 		 1127 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  26.15 
 
 		 1127 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  26.15 
 
 		 1127 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  29.21 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  30.17 
 
 		 521 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  26.58 
 
 		 559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  25.79 
 
 		 1127 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  28.74 
 
 		 762 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  26.81 
 
 		 855 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  28.23 
 
 		 657 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 		 1578 aa  129  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  29.41 
 
 		 854 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  30.33 
 
 		 861 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  32.15 
 
 		 540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  28.7 
 
 		 634 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  28.84 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 		 904 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  29.51 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  31.44 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  28.74 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  27.13 
 
 		 586 aa  124  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  28.47 
 
 		 542 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  32.37 
 
 		 662 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  30.9 
 
 		 536 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  26.15 
 
 		 699 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  27.85 
 
 		 699 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  27.85 
 
 		 699 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  27.85 
 
 		 699 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  25.92 
 
 		 699 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  26.96 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  28.87 
 
 		 532 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  27.37 
 
 		 675 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  26.79 
 
 		 505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  25.51 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  27.9 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  27.86 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  25.65 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  24.27 
 
 		 499 aa  106  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 		 472 aa  106  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  29.64 
 
 		 563 aa  103  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  26.3 
 
 		 1362 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  28.05 
 
 		 763 aa  100  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  28.9 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>