More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1136 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06723  histidine kinase  53.17 
 
 		 686 aa  696    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000816  signal transduction histidine kinase  53.37 
 
 		 690 aa  697    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1136  putative C4-dicarboxylate transport sensor protein  100 
 
 		 684 aa  1393    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00183456  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2874  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 693 aa  362  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0914  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 771 aa  201  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 683 aa  187  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  39.27 
 
 		 616 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  42.44 
 
 		 666 aa  183  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  36.02 
 
 		 677 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  36.02 
 
 		 677 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  42.07 
 
 		 666 aa  180  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  36.99 
 
 		 669 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  37.15 
 
 		 669 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 669 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 		 677 aa  178  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 		 672 aa  178  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 669 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  37.25 
 
 		 659 aa  177  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  36.02 
 
 		 677 aa  174  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  37.57 
 
 		 668 aa  174  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 591 aa  174  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  36.02 
 
 		 677 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  43.8 
 
 		 592 aa  171  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 588 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206032  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 623 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  39.92 
 
 		 665 aa  167  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 672 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 627 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  40.23 
 
 		 623 aa  167  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  39.92 
 
 		 670 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  39.39 
 
 		 627 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  38.68 
 
 		 602 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  41.3 
 
 		 600 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 634 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  36.59 
 
 		 633 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 634 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 635 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 631 aa  164  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  35.74 
 
 		 618 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 638 aa  163  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 637 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 634 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 630 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.941233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  39.77 
 
 		 626 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 634 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 634 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1462  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 600 aa  160  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0277816  normal  0.69414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  39.02 
 
 		 604 aa  160  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 668 aa  160  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 585 aa  159  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572324  normal  0.76853 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5344  histidine kinase  39.61 
 
 		 611 aa  159  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  33.84 
 
 		 597 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 604 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 652 aa  158  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  37.23 
 
 		 612 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  41.53 
 
 		 585 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  37.35 
 
 		 630 aa  157  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  37.23 
 
 		 599 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  37.98 
 
 		 604 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  38.61 
 
 		 621 aa  156  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  39.92 
 
 		 621 aa  156  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  35.23 
 
 		 604 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 604 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2129  sensor histidine kinase  38.64 
 
 		 587 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178359  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  34.15 
 
 		 604 aa  156  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 604 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  37.07 
 
 		 600 aa  155  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 627 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 585 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  35.99 
 
 		 604 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 622 aa  154  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 621 aa  154  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 		 586 aa  154  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  35.07 
 
 		 635 aa  154  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  37.64 
 
 		 586 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  37.94 
 
 		 626 aa  153  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 604 aa  153  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 585 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  37.36 
 
 		 588 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 585 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  40.08 
 
 		 585 aa  151  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 628 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  34.59 
 
 		 613 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  33.2 
 
 		 617 aa  146  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  36.9 
 
 		 600 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 597 aa  146  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0801303  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 643 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  36.31 
 
 		 590 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  34.21 
 
 		 634 aa  144  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  34.12 
 
 		 643 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  34.12 
 
 		 643 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  34.12 
 
 		 643 aa  144  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  35.41 
 
 		 667 aa  143  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  35.79 
 
 		 622 aa  143  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  34.87 
 
 		 635 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 607 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  35.71 
 
 		 594 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1510  C4-dicarboxylate transport sensor protein dctB  33.79 
 
 		 322 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.220294  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  33.08 
 
 		 608 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.10547 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  36.07 
 
 		 615 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>