More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0566 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 202 aa  409  1e-113  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf682  ribosomal protein S4  54.5 
 
 		 200 aa  216  2e-55  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000995603  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  51.94 
 
 		 208 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl586  30S ribosomal protein S4  53.62 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352215  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  52.94 
 
 		 200 aa  194  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  52.45 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  50.96 
 
 		 203 aa  192  4e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 203 aa  191  5e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 224 aa  187  5.999999999999999e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  50.49 
 
 		 200 aa  187  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  50.49 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 200 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  49.28 
 
 		 203 aa  181  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  49.76 
 
 		 262 aa  179  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  178  4e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  48.04 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  177  9e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  177  9e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 208 aa  177  9e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  44.98 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 203 aa  167  7e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  44.17 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  43.96 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  47.57 
 
 		 202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  43.69 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  44.17 
 
 		 205 aa  161  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  44.39 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0983  SSU ribosomal protein S4P  44.93 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923822  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  44.39 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  44.39 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  40.69 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  43.27 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  43.96 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  44.02 
 
 		 208 aa  157  9e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0779  30S ribosomal protein S4  45.71 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600575 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  44.39 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  44.93 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  44.93 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  44.17 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  43.96 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  43.81 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0456  30S ribosomal protein S4  44.98 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.189833  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  42.92 
 
 		 209 aa  154  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  42.92 
 
 		 209 aa  154  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  40.69 
 
 		 201 aa  155  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20600  30S ribosomal protein S4  43.2 
 
 		 202 aa  155  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.725693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  41.95 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0517  30S ribosomal protein S4  44.5 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4252  ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019621  unclonable  0.00000000000276102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  41.15 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  43.54 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  42.44 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  44.02 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  42.11 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  44.66 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04497  30S ribosomal protein S4  43.54 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.777393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0220  30S ribosomal protein S4  43 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000964484  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3735  30S ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000110035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  43 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  41.95 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  43 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4032  30S ribosomal protein S4  43 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000124947  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  43.41 
 
 		 201 aa  151  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  41.15 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 205 aa  151  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  40.67 
 
 		 208 aa  151  7e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  40.69 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  43 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2301  ribosomal protein S4  43.54 
 
 		 208 aa  150  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0792347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  43 
 
 		 206 aa  150  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0083  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  150  8.999999999999999e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000323728  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0172  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000508668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>