More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0482 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0482  ABC transporter related protein  100 
 
 
247 aa  496  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05240  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.71 
 
 
239 aa  198  7.999999999999999e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  39.84 
 
 
251 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0094  ABC transporter, ATP-binding protein  36.16 
 
 
255 aa  158  7e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0351427 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.4 
 
 
251 aa  151  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  41.01 
 
 
288 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  39.7 
 
 
290 aa  148  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  37.55 
 
 
295 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21580  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.52 
 
 
244 aa  146  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114361  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  38.33 
 
 
286 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  35.08 
 
 
295 aa  145  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  38.21 
 
 
267 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.21 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  37.37 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  37.45 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  34.78 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  33.85 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  34.15 
 
 
290 aa  134  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.65 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  36.49 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  34.06 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  36.04 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 
290 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 
282 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  33.05 
 
 
296 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  38.78 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  31.6 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  35.55 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  31.6 
 
 
301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  31.13 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  31.13 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  38.03 
 
 
284 aa  128  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1705  ABC transporter related  32.93 
 
 
236 aa  128  8.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  30.51 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1414  ABC transporter related  31.84 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0134  ABC transporter related  31.8 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  31.5 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  32.8 
 
 
309 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  30.63 
 
 
295 aa  126  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  33.94 
 
 
299 aa  125  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.92 
 
 
234 aa  125  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.451187  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  32.11 
 
 
338 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0690  ABC transporter related  38.91 
 
 
319 aa  125  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  38.54 
 
 
304 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  34.67 
 
 
300 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  32.11 
 
 
338 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1642  ABC transporter related  33.07 
 
 
308 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00844741  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  27.35 
 
 
308 aa  124  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  32.35 
 
 
302 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  31.93 
 
 
302 aa  123  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  31.58 
 
 
302 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  34.76 
 
 
321 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  30.28 
 
 
294 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  34.76 
 
 
334 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  36.49 
 
 
301 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2613  ABC transporter-related protein  35.92 
 
 
299 aa  122  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  29.79 
 
 
301 aa  121  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  37.56 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1746  ABC transporter-related protein  35.29 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  32.84 
 
 
338 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  32.42 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  34.93 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  38.34 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2522  ABC transporter related  31.47 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.575143  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1756  ABC transporter related  31.56 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55189  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  31.51 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0975  ABC transporter related  35.56 
 
 
391 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  33.48 
 
 
306 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  37.39 
 
 
301 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1800  ABC transporter related  31.56 
 
 
303 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.72569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1969  ABC transporter, ATP-binding protein  34.63 
 
 
301 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0565682  normal  0.106232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2053  ABC transporter related  33.98 
 
 
299 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0394425  normal  0.0287688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  30 
 
 
314 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  32.37 
 
 
286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1763  ABC transporter related  31.56 
 
 
303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.842524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  34.06 
 
 
301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.13 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.905308  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  31.13 
 
 
292 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.94 
 
 
308 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4204  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.93 
 
 
355 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129707  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  32.8 
 
 
308 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  33.18 
 
 
305 aa  118  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0659  ABC transporter, ATP-binding protein  34.69 
 
 
286 aa  118  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
297 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  31.63 
 
 
292 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  32.56 
 
 
314 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  35.09 
 
 
317 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  30.64 
 
 
292 aa  118  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  31.63 
 
 
292 aa  118  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  29.96 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  30.26 
 
 
327 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  34.04 
 
 
297 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  32.59 
 
 
932 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  31.8 
 
 
307 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  31.63 
 
 
292 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1723  ABC transporter related  36.54 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0159508  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0216  ABC transporter related  36.68 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  36.4 
 
 
323 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0387  ABC transporter, ATP-binding protein; GldA-related gliding motility protein  30.22 
 
 
249 aa  116  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.225863  normal  0.584755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>