More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0581 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  100 
 
 		 245 aa  490  9.999999999999999e-139  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  57.45 
 
 		 245 aa  281  6.000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  55.32 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  56.72 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  55.32 
 
 		 244 aa  271  9e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  51.67 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  54.31 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  54.74 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  55.6 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  51.88 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  50 
 
 		 501 aa  241  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  52.72 
 
 		 343 aa  241  9e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  55.17 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  34.11 
 
 		 241 aa  121  9e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  36.89 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  33.47 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  33.47 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  31.93 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  31.93 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0395  ribonuclease PH  35.06 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4210  ribonuclease PH  34.02 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  31.93 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  31.93 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  31.93 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  32.07 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  31.93 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  31.09 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  32.17 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  31.8 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  32.49 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  30.96 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  30.96 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1057  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.93 
 
 		 701 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000971525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  30.8 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1612  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.86 
 
 		 699 aa  101  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.322426  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1031  ribonuclease PH  31.69 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  30.04 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  31.36 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  30.58 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  32.91 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  32.63 
 
 		 244 aa  99.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0488  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.08 
 
 		 732 aa  99.4  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  33.06 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4016  ribonuclease PH  33.63 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.761364  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  30.57 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3479  ribonuclease PH  30.13 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0773  ribonuclease PH  35.02 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  32.49 
 
 		 240 aa  99  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  33.05 
 
 		 242 aa  98.6  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  33.05 
 
 		 242 aa  98.6  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  34.39 
 
 		 238 aa  98.6  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  32.49 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  31.2 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_006686  CND05300  conserved hypothetical protein  31.51 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.325732  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0953  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.45 
 
 		 735 aa  98.2  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  31.76 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0790  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.55 
 
 		 703 aa  97.8  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  31.93 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1484  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.58 
 
 		 708 aa  97.1  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0201008  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1438  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.58 
 
 		 708 aa  97.1  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1161  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.41 
 
 		 712 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000184021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  30.67 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2745  ribonuclease PH  32.64 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  36.45 
 
 		 705 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  29.96 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  32.38 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  32.49 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0719  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  32.64 
 
 		 752 aa  96.3  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000106259  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  32.49 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  35.15 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  33.2 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  31.25 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0569  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.8 
 
 		 695 aa  95.5  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  30.34 
 
 		 247 aa  95.1  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0332  ribonuclease PH  32.6 
 
 		 237 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0178765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1546  ribonuclease PH  31.54 
 
 		 241 aa  95.5  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.760762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  30.89 
 
 		 260 aa  95.1  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  31.09 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3937  ribonuclease PH  31.49 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.510656  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0425  ribonuclease PH  33.78 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  30.42 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  31.22 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  28.97 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  31.22 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.91 
 
 		 700 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  31.39 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  34.03 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  33.19 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  30.04 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  30 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0395  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  33.05 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  31.22 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  32.05 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  29.96 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2997  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.45 
 
 		 711 aa  93.2  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16766  predicted protein  36.91 
 
 		 140 aa  93.2  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.614591  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  32.11 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1146  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  34.78 
 
 		 693 aa  93.2  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>