99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4148 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  100 
 
 
294 aa  573  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4168  cysteine dioxygenase type I  61.96 
 
 
176 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4234  cysteine dioxygenase type I  61.96 
 
 
176 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4390  cysteine dioxygenase type I  61.96 
 
 
176 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4684  cysteine dioxygenase type I  62.73 
 
 
171 aa  185  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0553076  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2033  cysteine dioxygenase type I  60.25 
 
 
172 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3322  cysteine dioxygenase type I  59.01 
 
 
195 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11083  hypothetical protein  57.58 
 
 
188 aa  165  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.334269999999999e-45  normal  0.140472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  70.69 
 
 
138 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  73.04 
 
 
124 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  73.04 
 
 
124 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  73.04 
 
 
124 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  69.23 
 
 
122 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  67.8 
 
 
122 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  59.68 
 
 
163 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1387  cysteine dioxygenase type I  52.63 
 
 
178 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240375  normal  0.0417465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  77.17 
 
 
131 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  56.92 
 
 
134 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  56.25 
 
 
141 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  60.5 
 
 
140 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  61.21 
 
 
127 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  62.5 
 
 
124 aa  125  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  54.46 
 
 
130 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  51.33 
 
 
133 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  53.98 
 
 
131 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  46.43 
 
 
131 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  51.09 
 
 
204 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0473  cysteine dioxygenase type I  41.09 
 
 
152 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1688  cysteine dioxygenase type I  38.57 
 
 
153 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287539  normal  0.148043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1317  cysteine dioxygenase type I  38.52 
 
 
168 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1484  cysteine dioxygenase type I  35.29 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.346783 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
129 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  35.59 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  37.07 
 
 
137 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4981  cysteine dioxygenase type I  38.18 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal  0.731628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1290  cysteine dioxygenase type I  36.84 
 
 
209 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0248002  normal  0.323181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1288  cysteine dioxygenase type I  36.88 
 
 
186 aa  63.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198462  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 
125 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7922  hypothetical protein  35.11 
 
 
170 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  35.4 
 
 
140 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  37.1 
 
 
130 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  35.09 
 
 
128 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  31.19 
 
 
131 aa  59.7  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3083  cysteine dioxygenase type I  33.93 
 
 
165 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.569754  normal  0.0821213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 
128 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  32.76 
 
 
138 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  34.34 
 
 
130 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
130 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  31.62 
 
 
138 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2234  cysteine dioxygenase type I  38.38 
 
 
167 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  32.2 
 
 
141 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
130 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  32.17 
 
 
136 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
140 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6068  cysteine dioxygenase type I  35.14 
 
 
207 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172595  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  33.91 
 
 
130 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  30.19 
 
 
129 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5989  cysteine dioxygenase type I  31 
 
 
155 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  32.76 
 
 
140 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  33.04 
 
 
137 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  32.46 
 
 
361 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  30.7 
 
 
137 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  32.5 
 
 
126 aa  52.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  32.46 
 
 
124 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  33.07 
 
 
141 aa  52.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  32.43 
 
 
120 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  31.3 
 
 
126 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  28.83 
 
 
125 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  30.7 
 
 
134 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2559  cysteine dioxygenase type I superfamily  22.86 
 
 
147 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2602  hypothetical protein  22.86 
 
 
147 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000300712  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.21 
 
 
480 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  29.82 
 
 
136 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0570  hypothetical protein  35.63 
 
 
124 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.739902  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  33.64 
 
 
131 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 
131 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  29.09 
 
 
126 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  28.83 
 
 
123 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  28.57 
 
 
125 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  29.84 
 
 
136 aa  47  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 
131 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  30.86 
 
 
133 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5002  rhodanese domain-containing protein  30.39 
 
 
104 aa  46.2  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.589759  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  33.06 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34290  Rhodanese-related sulfurtransferase  34.95 
 
 
178 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.128356 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43654  cysteine dioxygenase  25.71 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.277874 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  28.74 
 
 
127 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.25 
 
 
380 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21480  hypothetical protein  29.71 
 
 
200 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245362  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  33.91 
 
 
133 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.52 
 
 
472 aa  43.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  34.38 
 
 
459 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 
459 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 
459 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  29.2 
 
 
130 aa  42.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.19 
 
 
389 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 
467 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 
143 aa  42.7  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  36.05 
 
 
459 aa  42.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>