23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1288 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1288  cysteine dioxygenase type I  100 
 
 		 186 aa  368  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198462  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7922  hypothetical protein  67.52 
 
 		 170 aa  218  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1290  cysteine dioxygenase type I  56.88 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0248002  normal  0.323181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1317  cysteine dioxygenase type I  51.61 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0473  cysteine dioxygenase type I  39.39 
 
 		 152 aa  92  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1387  cysteine dioxygenase type I  37.04 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240375  normal  0.0417465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4981  cysteine dioxygenase type I  38.58 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal  0.731628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4168  cysteine dioxygenase type I  38.46 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4234  cysteine dioxygenase type I  38.46 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4390  cysteine dioxygenase type I  38.46 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2033  cysteine dioxygenase type I  34.62 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5989  cysteine dioxygenase type I  32.82 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1688  cysteine dioxygenase type I  31.91 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287539  normal  0.148043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2234  cysteine dioxygenase type I  39.39 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3322  cysteine dioxygenase type I  30.06 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4684  cysteine dioxygenase type I  33.08 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0553076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  35.38 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3083  cysteine dioxygenase type I  35.61 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.569754  normal  0.0821213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11083  hypothetical protein  31.54 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.334269999999999e-45  normal  0.140472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1484  cysteine dioxygenase type I  31.71 
 
 		 228 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.346783 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2602  hypothetical protein  24.21 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000300712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2559  cysteine dioxygenase type I superfamily  25.26 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6068  cysteine dioxygenase type I  33.08 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>