26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6068 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6068  cysteine dioxygenase type I  100 
 
 		 207 aa  407  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3083  cysteine dioxygenase type I  59.62 
 
 		 165 aa  178  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.569754  normal  0.0821213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4981  cysteine dioxygenase type I  41.73 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal  0.731628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1688  cysteine dioxygenase type I  48.15 
 
 		 153 aa  88.6  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287539  normal  0.148043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0473  cysteine dioxygenase type I  47.27 
 
 		 152 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1484  cysteine dioxygenase type I  36.97 
 
 		 228 aa  85.1  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.346783 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1387  cysteine dioxygenase type I  39.69 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240375  normal  0.0417465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2234  cysteine dioxygenase type I  47.19 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11083  hypothetical protein  40.35 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.334269999999999e-45  normal  0.140472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1317  cysteine dioxygenase type I  35.82 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4390  cysteine dioxygenase type I  40.38 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4168  cysteine dioxygenase type I  40.38 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4234  cysteine dioxygenase type I  40.38 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3322  cysteine dioxygenase type I  38.05 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1290  cysteine dioxygenase type I  36.15 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0248002  normal  0.323181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5989  cysteine dioxygenase type I  39.8 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2033  cysteine dioxygenase type I  38.18 
 
 		 172 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4684  cysteine dioxygenase type I  37.61 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0553076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  38.94 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1288  cysteine dioxygenase type I  33.33 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198462  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7922  hypothetical protein  32.52 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4230  cysteine dioxygenase type I  38.46 
 
 		 144 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2602  hypothetical protein  24.73 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000300712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1508  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily-like protein  32.67 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.221048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2559  cysteine dioxygenase type I superfamily  23.66 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2309  cysteine dioxygenase type I  32.58 
 
 		 173 aa  41.6  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54991  normal  0.0277582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>