31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5989 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5989  cysteine dioxygenase type I  100 
 
 		 155 aa  314  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09140  cupin domain-containing protein  50.99 
 
 		 133 aa  123  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1688  cysteine dioxygenase type I  45.13 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287539  normal  0.148043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0473  cysteine dioxygenase type I  39.06 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4981  cysteine dioxygenase type I  41.38 
 
 		 211 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal  0.731628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2234  cysteine dioxygenase type I  50 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1484  cysteine dioxygenase type I  36.64 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.346783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4230  cysteine dioxygenase type I  44.76 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3083  cysteine dioxygenase type I  41.84 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.569754  normal  0.0821213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3322  cysteine dioxygenase type I  43.75 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1288  cysteine dioxygenase type I  34.17 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198462  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4234  cysteine dioxygenase type I  37.23 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4390  cysteine dioxygenase type I  37.23 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4168  cysteine dioxygenase type I  37.23 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11083  hypothetical protein  42.11 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.334269999999999e-45  normal  0.140472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1387  cysteine dioxygenase type I  35.71 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240375  normal  0.0417465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4684  cysteine dioxygenase type I  36.73 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0553076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2033  cysteine dioxygenase type I  40.79 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  31 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7922  hypothetical protein  36.25 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1317  cysteine dioxygenase type I  33.04 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6068  cysteine dioxygenase type I  39.8 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172595  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1290  cysteine dioxygenase type I  39.24 
 
 		 209 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0248002  normal  0.323181 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2602  hypothetical protein  25.97 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000300712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2559  cysteine dioxygenase type I superfamily  24.68 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  33.33 
 
 		 189 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2309  cysteine dioxygenase type I  33.33 
 
 		 173 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54991  normal  0.0277582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2507  cysteine dioxygenase type I  30.71 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0215877  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2660  hypothetical protein  30.07 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000212284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2667  hypothetical protein  29.92 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0160743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2657  hypothetical protein  30.71 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>