29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0473 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0473  cysteine dioxygenase type I  100 
 
 
152 aa  309  6.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1688  cysteine dioxygenase type I  48.28 
 
 
153 aa  121  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287539  normal  0.148043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1387  cysteine dioxygenase type I  45.52 
 
 
178 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240375  normal  0.0417465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1290  cysteine dioxygenase type I  41.13 
 
 
209 aa  97.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0248002  normal  0.323181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11083  hypothetical protein  43.85 
 
 
188 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.334269999999999e-45  normal  0.140472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2234  cysteine dioxygenase type I  54.84 
 
 
167 aa  92.8  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4168  cysteine dioxygenase type I  45.76 
 
 
176 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4234  cysteine dioxygenase type I  45.76 
 
 
176 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4390  cysteine dioxygenase type I  45.76 
 
 
176 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1288  cysteine dioxygenase type I  39.39 
 
 
186 aa  91.7  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198462  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3322  cysteine dioxygenase type I  37.21 
 
 
195 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2033  cysteine dioxygenase type I  37.13 
 
 
172 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1317  cysteine dioxygenase type I  39.71 
 
 
168 aa  87.8  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4684  cysteine dioxygenase type I  36.14 
 
 
171 aa  87  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0553076  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  41.09 
 
 
294 aa  87  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3083  cysteine dioxygenase type I  45.37 
 
 
165 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.569754  normal  0.0821213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7922  hypothetical protein  35.42 
 
 
170 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1484  cysteine dioxygenase type I  41.35 
 
 
228 aa  85.5  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.346783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5989  cysteine dioxygenase type I  39.06 
 
 
155 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4981  cysteine dioxygenase type I  40.17 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal  0.731628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6068  cysteine dioxygenase type I  46.73 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2602  hypothetical protein  30.53 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000300712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2559  cysteine dioxygenase type I superfamily  29.47 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4230  cysteine dioxygenase type I  36.19 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  33.33 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0873  cysteine dioxygenase type I  26.05 
 
 
205 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 
178 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2986  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 
178 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0454  cysteine dioxygenase type I  39.76 
 
 
184 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>