27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1387 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1387  cysteine dioxygenase type I  100 
 
 		 178 aa  350  7e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240375  normal  0.0417465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  55.78 
 
 		 294 aa  140  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4168  cysteine dioxygenase type I  52.05 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4234  cysteine dioxygenase type I  52.05 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4390  cysteine dioxygenase type I  52.05 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3322  cysteine dioxygenase type I  47.46 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4684  cysteine dioxygenase type I  57.69 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0553076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2033  cysteine dioxygenase type I  49.12 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11083  hypothetical protein  44.44 
 
 		 188 aa  124  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.334269999999999e-45  normal  0.140472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0473  cysteine dioxygenase type I  46.97 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1688  cysteine dioxygenase type I  46.9 
 
 		 153 aa  99.8  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287539  normal  0.148043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1317  cysteine dioxygenase type I  40 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1484  cysteine dioxygenase type I  36.43 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.346783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1290  cysteine dioxygenase type I  38.69 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0248002  normal  0.323181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6068  cysteine dioxygenase type I  39.23 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172595  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4981  cysteine dioxygenase type I  37.5 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal  0.731628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1288  cysteine dioxygenase type I  37.14 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198462  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3083  cysteine dioxygenase type I  36.84 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.569754  normal  0.0821213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2234  cysteine dioxygenase type I  46.32 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7922  hypothetical protein  36.17 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5989  cysteine dioxygenase type I  35.71 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2602  hypothetical protein  28.42 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000300712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0873  cysteine dioxygenase type I  30.17 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2559  cysteine dioxygenase type I superfamily  28.12 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4230  cysteine dioxygenase type I  34.96 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43654  cysteine dioxygenase  29.21 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.277874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0030  cysteine dioxygenase type I  30.77 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174778  hitchhiker  0.0000000079419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>