28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1484 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1484  cysteine dioxygenase type I  100 
 
 		 228 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.346783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4981  cysteine dioxygenase type I  54.87 
 
 		 211 aa  197  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal  0.731628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3083  cysteine dioxygenase type I  40.14 
 
 		 165 aa  88.6  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.569754  normal  0.0821213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0473  cysteine dioxygenase type I  41.35 
 
 		 152 aa  85.5  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1688  cysteine dioxygenase type I  37.88 
 
 		 153 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287539  normal  0.148043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1387  cysteine dioxygenase type I  37.12 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240375  normal  0.0417465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5989  cysteine dioxygenase type I  38.1 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1317  cysteine dioxygenase type I  37.88 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6068  cysteine dioxygenase type I  35.43 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172595  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11083  hypothetical protein  37.17 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.334269999999999e-45  normal  0.140472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4390  cysteine dioxygenase type I  38.1 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4234  cysteine dioxygenase type I  38.1 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4168  cysteine dioxygenase type I  38.1 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3322  cysteine dioxygenase type I  34.78 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2033  cysteine dioxygenase type I  39.45 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  34.03 
 
 		 294 aa  68.6  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1290  cysteine dioxygenase type I  35.04 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0248002  normal  0.323181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4684  cysteine dioxygenase type I  35.19 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0553076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2234  cysteine dioxygenase type I  37.04 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1288  cysteine dioxygenase type I  30.53 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198462  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7922  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969512 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2602  hypothetical protein  24.8 
 
 		 147 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000300712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2559  cysteine dioxygenase type I superfamily  25.58 
 
 		 147 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4230  cysteine dioxygenase type I  30 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43654  cysteine dioxygenase  26.67 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.277874 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04081  cysteine dioxygenase Cdo1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05570)  25.64 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0171854  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  36.08 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3618  cysteine dioxygenase type I  31.79 
 
 		 188 aa  41.6  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>