More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4114 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4114  amidohydrolase  100 
 
 		 385 aa  759    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2199  amidohydrolase  57.7 
 
 		 395 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.320841  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2454  amidohydrolase  53.54 
 
 		 394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0219  peptidase M20D, amidohydrolase  53.21 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1645  hippurate hydrolase  50.82 
 
 		 368 aa  368  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  42.94 
 
 		 387 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  43.28 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  41.4 
 
 		 379 aa  269  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  41.24 
 
 		 388 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  43.13 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  42.66 
 
 		 387 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  40.65 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  42.01 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1211  amidohydrolase  44.44 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.108173  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  40.59 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  40.77 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  45.05 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  39.84 
 
 		 398 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  41.46 
 
 		 395 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  41.32 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  36.43 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  41.16 
 
 		 406 aa  256  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  40.96 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  40.92 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  40.92 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  40.92 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  40.43 
 
 		 387 aa  252  8.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  39.62 
 
 		 385 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  38.46 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  41.06 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0803  hippurate hydrolase  34.4 
 
 		 383 aa  249  6e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  40.77 
 
 		 387 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1004  hippurate hydrolase  35.16 
 
 		 383 aa  248  9e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1067  hippurate hydrolase  34.93 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.956056  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  43.75 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  39.4 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  42.54 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  38.2 
 
 		 423 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  42.21 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31131  predicted protein  40.21 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  43.18 
 
 		 388 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  41.42 
 
 		 387 aa  246  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  42.22 
 
 		 389 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  39.78 
 
 		 386 aa  246  6.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  43.14 
 
 		 395 aa  245  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  43.63 
 
 		 388 aa  245  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0220  amidohydrolase  35.15 
 
 		 389 aa  245  9e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  39.15 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  41.3 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  40.27 
 
 		 406 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  38.93 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  36.88 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  40.73 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  44.16 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  39.73 
 
 		 387 aa  244  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  37.16 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  41.06 
 
 		 396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  37.82 
 
 		 397 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  41.16 
 
 		 402 aa  243  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  41.1 
 
 		 390 aa  242  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1882  peptidase, M20/M25/M40 family  38.81 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  36.04 
 
 		 380 aa  242  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  41.73 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  39.59 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  40.73 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  37.6 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  37.87 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  39.78 
 
 		 403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  41.18 
 
 		 415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  41.18 
 
 		 415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  41.18 
 
 		 396 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  40.27 
 
 		 405 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  40 
 
 		 399 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  39.24 
 
 		 387 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  40.17 
 
 		 392 aa  239  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  39.24 
 
 		 387 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  38.27 
 
 		 386 aa  238  9e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  40.7 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  41.53 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3033  peptidase M20D, amidohydrolase  37.08 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  41.13 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  40.06 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  39.29 
 
 		 388 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  40.17 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  43.22 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  40.8 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  40.7 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  43.47 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  40.8 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  41.69 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  38.15 
 
 		 401 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  40 
 
 		 393 aa  236  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  34.73 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  40.27 
 
 		 391 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  38.15 
 
 		 401 aa  235  9e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  40.73 
 
 		 388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  39.25 
 
 		 388 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  39.45 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  37.13 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  40.73 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>