More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2199 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2199  amidohydrolase  100 
 
 
395 aa  803    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.320841  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0219  peptidase M20D, amidohydrolase  59.69 
 
 
390 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2454  amidohydrolase  56.81 
 
 
394 aa  444  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4114  amidohydrolase  57.7 
 
 
385 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1645  hippurate hydrolase  55.98 
 
 
368 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  40.76 
 
 
379 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  40.69 
 
 
399 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  41.8 
 
 
385 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  39.68 
 
 
388 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  40.77 
 
 
387 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1882  peptidase, M20/M25/M40 family  41.27 
 
 
385 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  40.27 
 
 
399 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  40.32 
 
 
402 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  40.74 
 
 
386 aa  249  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  39.78 
 
 
389 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  38.62 
 
 
396 aa  249  8e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  40.77 
 
 
387 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  39.95 
 
 
403 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  41.62 
 
 
395 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  41.98 
 
 
384 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  39.57 
 
 
398 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  41.76 
 
 
385 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  38.16 
 
 
387 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  40.5 
 
 
387 aa  246  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  41.62 
 
 
395 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  41.37 
 
 
388 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1211  amidohydrolase  41.3 
 
 
384 aa  246  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.108173  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  42.34 
 
 
395 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  38.61 
 
 
398 aa  245  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  42.34 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  40.33 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  42.34 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  38.29 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  36.16 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  39.84 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  38.34 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.71 
 
 
381 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  37.47 
 
 
403 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  39.2 
 
 
379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  37.88 
 
 
387 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1004  hippurate hydrolase  34.67 
 
 
383 aa  239  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  40.17 
 
 
392 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1067  hippurate hydrolase  34.76 
 
 
383 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.956056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0803  hippurate hydrolase  34.22 
 
 
383 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  41.44 
 
 
388 aa  239  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  41.9 
 
 
391 aa  239  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  38.11 
 
 
389 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  38.98 
 
 
381 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  38.92 
 
 
398 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  41.1 
 
 
387 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  40 
 
 
386 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  39.94 
 
 
390 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  38.61 
 
 
397 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  38.25 
 
 
399 aa  237  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  40 
 
 
388 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  38.13 
 
 
397 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  38.34 
 
 
396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  38.98 
 
 
404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  40 
 
 
386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  38.56 
 
 
390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  40.98 
 
 
388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  39.21 
 
 
388 aa  236  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  39.3 
 
 
397 aa  235  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  38.7 
 
 
425 aa  235  9e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  37.02 
 
 
381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  40.16 
 
 
415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  37.4 
 
 
397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  37.98 
 
 
412 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  40.16 
 
 
415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  39.2 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  38.4 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  39.37 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  40.16 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  38.48 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  38.73 
 
 
388 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  40.11 
 
 
396 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  40.16 
 
 
396 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  38.5 
 
 
384 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  38.29 
 
 
387 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  38.77 
 
 
389 aa  232  9e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  37.27 
 
 
396 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  40.16 
 
 
388 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  39.68 
 
 
399 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  37.27 
 
 
396 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  39.95 
 
 
388 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  37.63 
 
 
381 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  40.71 
 
 
390 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  37.77 
 
 
388 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  38.33 
 
 
408 aa  230  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  39.4 
 
 
393 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  36.63 
 
 
390 aa  230  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  38.54 
 
 
408 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  40.77 
 
 
388 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0512  peptidase M20D, amidohydrolase  42.05 
 
 
379 aa  229  6e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  37.9 
 
 
381 aa  229  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  39.12 
 
 
396 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1708  peptidase M20D, amidohydrolase  40.55 
 
 
389 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.971842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  39.04 
 
 
424 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  39.4 
 
 
395 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  37.19 
 
 
394 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>