More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1591 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  100 
 
 		 513 aa  1017    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  75.86 
 
 		 519 aa  657    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  64.53 
 
 		 503 aa  587  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  48.72 
 
 		 521 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  49.12 
 
 		 521 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  49.12 
 
 		 521 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  55.15 
 
 		 531 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  47.38 
 
 		 538 aa  422  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  45.59 
 
 		 506 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  52.2 
 
 		 549 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  47.49 
 
 		 562 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 494 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 		 505 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 		 547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  29.03 
 
 		 506 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 		 505 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  31.65 
 
 		 510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  32.66 
 
 		 483 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  32.66 
 
 		 483 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  29.69 
 
 		 486 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  29.69 
 
 		 486 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  29.69 
 
 		 486 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  32.89 
 
 		 487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  32.39 
 
 		 527 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 		 502 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  32.98 
 
 		 496 aa  161  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  29.67 
 
 		 519 aa  160  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  33.19 
 
 		 492 aa  159  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  33.63 
 
 		 499 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  31.06 
 
 		 483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  33.41 
 
 		 539 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  33.41 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  31.26 
 
 		 483 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  29.25 
 
 		 528 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  30.09 
 
 		 522 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  28.14 
 
 		 521 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 497 aa  148  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  28.94 
 
 		 496 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  29.58 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  28.87 
 
 		 504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  28.3 
 
 		 523 aa  126  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  29.25 
 
 		 522 aa  124  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 		 514 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 514 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  29.6 
 
 		 516 aa  114  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  26.1 
 
 		 530 aa  113  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 543 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 530 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 520 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  23.42 
 
 		 515 aa  108  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  24.57 
 
 		 570 aa  106  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  25.85 
 
 		 510 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  26.01 
 
 		 547 aa  102  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  25 
 
 		 518 aa  98.6  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.14 
 
 		 532 aa  96.7  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 454 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 476 aa  93.6  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 454 aa  93.6  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 476 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  29.07 
 
 		 468 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 		 455 aa  90.5  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.73 
 
 		 542 aa  90.1  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  25.09 
 
 		 526 aa  90.1  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  23.71 
 
 		 570 aa  89.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  24.15 
 
 		 514 aa  89  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 486 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  26.09 
 
 		 495 aa  88.6  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 466 aa  88.6  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  25.85 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  25.65 
 
 		 538 aa  88.2  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 466 aa  87.4  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 466 aa  86.7  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 468 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  25.27 
 
 		 443 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.76 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  29.21 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  27.51 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  21.98 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  22.45 
 
 		 537 aa  83.6  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  25.62 
 
 		 518 aa  83.6  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  28.06 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  28.06 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  28.06 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  27.82 
 
 		 467 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  28.3 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  28.3 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  28.3 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  28.3 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  26.81 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  22.99 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 495 aa  80.1  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>