More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3530 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3530  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417771  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  64.39 
 
 		 205 aa  267  7e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  64.39 
 
 		 205 aa  267  7e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1487  30S ribosomal protein S4  48.76 
 
 		 202 aa  176  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4303  30S ribosomal protein S4  49.25 
 
 		 202 aa  174  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000344205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 201 aa  174  8e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  41 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0787  30S ribosomal protein S4  47.03 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  40.8 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2554  30S ribosomal protein S4  46.77 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  47.76 
 
 		 203 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3730  30S ribosomal protein S4  47.76 
 
 		 202 aa  171  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.53592  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  43.5 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4418  30S ribosomal protein S4  47.26 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000122066  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4356  30S ribosomal protein S4  47.26 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  41.09 
 
 		 201 aa  168  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1590  30S ribosomal protein S4  45.27 
 
 		 202 aa  169  4e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2214  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  43.35 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0324  30S ribosomal protein S4  45.27 
 
 		 202 aa  168  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000000226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  45.77 
 
 		 200 aa  167  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4303  30S ribosomal protein S4  43.63 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1016  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 205 aa  167  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0662506  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0954  30S ribosomal protein S4  44.61 
 
 		 206 aa  166  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  44.98 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  43.06 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2283  30S ribosomal protein S4  44.61 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  43.06 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  40.3 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  44.02 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0958  30S ribosomal protein S4  44.61 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0208239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21161  30S ribosomal protein S4  44.78 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  46.27 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  46.27 
 
 		 200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04081  30S ribosomal protein S4  44.28 
 
 		 202 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  41.09 
 
 		 202 aa  164  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04611  30S ribosomal protein S4  43.78 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  42.51 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  45.37 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1744  30S ribosomal protein S4  43.78 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  40.8 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  43.96 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  43.06 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3514  30S ribosomal protein S4  43.63 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  40.29 
 
 		 206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1004  30S ribosomal protein S4  47.52 
 
 		 204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000950762  normal  0.0219645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  41.79 
 
 		 201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  42.08 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1256  30S ribosomal protein S4  42.16 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  0.108405 
 
 
-
 
NC_002620  TC0915  30S ribosomal protein S4  40.87 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  39.11 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  43.14 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1270  30S ribosomal protein S4  43.14 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450634  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 224 aa  158  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2245  30S ribosomal protein S4  42.65 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.892305  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  42.16 
 
 		 205 aa  158  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  43.78 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  43 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1140  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 204 aa  158  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.768431  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  41.58 
 
 		 203 aa  157  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  43.78 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0701  30S ribosomal protein S4  38.42 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  42.51 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2396  30S ribosomal protein S4  41.18 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0786  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  0.376942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2156  30S ribosomal protein S4  43.14 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0823  30S ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  43.07 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1947  30S ribosomal protein S4  43.14 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515321  normal  0.962011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  43.78 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  42.08 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  45.85 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0194  30S ribosomal protein S4  38.78 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1641  ribosomal protein S4  42.16 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0632  30S ribosomal protein S4  43.09 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000140472  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.43 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0830  30S ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0826  30S ribosomal protein S4  40.69 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0783117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  42.03 
 
 		 208 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  43.78 
 
 		 200 aa  154  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  43.78 
 
 		 200 aa  154  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  43.78 
 
 		 200 aa  154  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  43.78 
 
 		 200 aa  154  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  43.78 
 
 		 200 aa  154  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  43.78 
 
 		 200 aa  154  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0437  ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 203 aa  155  6e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000069036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  43.78 
 
 		 200 aa  154  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  43.06 
 
 		 208 aa  154  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  43 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0105  30S ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>