More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2362 on replicon NC_011667
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011667  Tmz1t_2362  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
201 aa  413  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0173378  hitchhiker  0.0000149348 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  81.59 
 
 
201 aa  338  2.9999999999999998e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.944243  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2319  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  53.44 
 
 
217 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127163  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3499  exonuclease  48.4 
 
 
198 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108148  hitchhiker  4.31103e-25 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003462  DNA polymerase III alpha subunit (gram-positive type)  44.81 
 
 
205 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02308  hypothetical protein  41.58 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0007  YacC  37.16 
 
 
282 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292935  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6889  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  41.57 
 
 
293 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.796423  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0012  DNA polymerase III fragment  36.93 
 
 
287 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0181  putative exonuclease  42.72 
 
 
289 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal  0.100194 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4217  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  37.23 
 
 
302 aa  98.6  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.77511  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4659  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.52 
 
 
203 aa  97.8  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.102752 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4798  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.72 
 
 
330 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  33.54 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.16 
 
 
695 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  30.99 
 
 
695 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.99 
 
 
695 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.76 
 
 
731 aa  69.3  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1500  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.03 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000153009  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3002  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.46 
 
 
372 aa  68.6  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  27.96 
 
 
707 aa  68.2  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  25.25 
 
 
1447 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.13 
 
 
944 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3559  DNA polymerase III subunit epsilon  32.24 
 
 
485 aa  65.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.33 
 
 
595 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  24.71 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1099  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.39 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1339  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.88 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0133405  hitchhiker  0.000000000461521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.76 
 
 
956 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  24.12 
 
 
315 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  31.21 
 
 
729 aa  64.7  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  31.76 
 
 
242 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  28.25 
 
 
250 aa  63.9  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.81 
 
 
230 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.87 
 
 
231 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2764  hypothetical protein  33.96 
 
 
120 aa  64.3  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.74 
 
 
243 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5104  hypothetical protein  30.65 
 
 
320 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.547359  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0495  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.69 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.17 
 
 
237 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  27.97 
 
 
315 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  28.99 
 
 
616 aa  63.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1010  DNA polymerase III subunit epsilon  31.25 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  36.46 
 
 
239 aa  63.5  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  30.34 
 
 
578 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  27.97 
 
 
315 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  27.97 
 
 
315 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0498  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.96 
 
 
240 aa  63.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.231087  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2625  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.9 
 
 
300 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401759  hitchhiker  0.000000993281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  27.97 
 
 
315 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2402  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.24 
 
 
242 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000797972  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29590  DNA polymerase III subunit epsilon  33.65 
 
 
244 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340517  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.17 
 
 
237 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1144  DNA polymerase III subunit epsilon  30.58 
 
 
245 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1872  DNA polymerase III subunit epsilon  29.71 
 
 
242 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000816139  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  22.95 
 
 
315 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1763  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.45 
 
 
236 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.312232 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0352  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.02 
 
 
426 aa  62.4  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  30.59 
 
 
242 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.56 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.66 
 
 
236 aa  62  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.7 
 
 
769 aa  62  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1486  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.55 
 
 
236 aa  62  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0964346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3135  DNA polymerase III subunit epsilon  29.75 
 
 
245 aa  62  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  27.12 
 
 
315 aa  61.6  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1485  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.45 
 
 
241 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00650497  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.09 
 
 
239 aa  61.6  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3714  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.64 
 
 
233 aa  61.6  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.349648  hitchhiker  0.000000325889 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  27.12 
 
 
1407 aa  61.6  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  35.24 
 
 
242 aa  61.2  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.28 
 
 
631 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  27.98 
 
 
1442 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  26.79 
 
 
315 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.48 
 
 
229 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  27.53 
 
 
570 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  27.32 
 
 
457 aa  60.1  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0603  DNA polymerase III subunit epsilon  29.63 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  27.12 
 
 
315 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0780  exonuclease  28.88 
 
 
203 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0912  DNA polymerase III subunit epsilon  28.93 
 
 
246 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.02 
 
 
232 aa  59.3  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  32.48 
 
 
229 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1041  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.76 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  28.65 
 
 
1440 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  32.57 
 
 
603 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3711  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.39 
 
 
257 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2067  DNA polymerase III subunit epsilon  30.93 
 
 
252 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186052  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.1 
 
 
238 aa  59.3  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.18 
 
 
659 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.23 
 
 
921 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1109  DNA polymerase III subunit epsilon  30.36 
 
 
254 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  28.16 
 
 
584 aa  58.9  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2682  DNA polymerase III subunit epsilon  30.36 
 
 
254 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1825  DNA polymerase III subunit epsilon  25.93 
 
 
247 aa  58.9  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  27.37 
 
 
601 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1055  DNA polymerase III subunit epsilon  30.36 
 
 
254 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.328501  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2111  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.24 
 
 
242 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000449377  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.13 
 
 
240 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0749  DNA polymerase III subunit epsilon  27.68 
 
 
245 aa  58.5  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.249034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00213  hypothetical protein  31.58 
 
 
243 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>