More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2156 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2156  ABC transporter related  100 
 
 		 225 aa  440  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.506853  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  62.07 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  61 
 
 		 217 aa  227  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  62 
 
 		 216 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  59.9 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5007  ABC transporter related  59.11 
 
 		 243 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.283517  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  59.5 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  60.59 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1640  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit  57.64 
 
 		 245 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0895  ABC transporter related  58.62 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.323995  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  58.82 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  55.56 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  55.96 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2035  ABC transporter, ATP-binding protein  56.72 
 
 		 219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0805  ABC transporter related  48.86 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  57.84 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 		 221 aa  187  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  49.77 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.26 
 
 		 646 aa  181  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  46.51 
 
 		 648 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.51 
 
 		 648 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  45.41 
 
 		 251 aa  179  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  46.51 
 
 		 648 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.51 
 
 		 648 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.51 
 
 		 648 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.51 
 
 		 648 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.51 
 
 		 648 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.26 
 
 		 648 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  46.51 
 
 		 648 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.26 
 
 		 648 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.26 
 
 		 648 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  46.05 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  51.18 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.79 
 
 		 648 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  48.21 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  50.24 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.79 
 
 		 648 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  47.69 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.23 
 
 		 649 aa  174  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.23 
 
 		 649 aa  174  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.75 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  41.55 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.75 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  46.98 
 
 		 247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  50 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  45.79 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  47.93 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  51.67 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  42.79 
 
 		 653 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.04 
 
 		 648 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  41.67 
 
 		 240 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  46.54 
 
 		 237 aa  171  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  42.93 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 		 654 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  49.75 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  47.91 
 
 		 235 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  46.95 
 
 		 251 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  47.96 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  46.12 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  48.62 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  48.06 
 
 		 241 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2040  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.81 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  53.72 
 
 		 277 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0276  ABC transporter related protein  41.12 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.98 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  43.59 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  49.21 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.21 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  49.21 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  43.29 
 
 		 234 aa  168  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.21 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  43.44 
 
 		 668 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  49.21 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  38.32 
 
 		 293 aa  168  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.21 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 235 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.21 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  43.59 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.21 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  50.76 
 
 		 233 aa  168  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  41.59 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  41.41 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  41.59 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  47.52 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.37 
 
 		 642 aa  168  6e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  44.86 
 
 		 233 aa  167  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.74 
 
 		 242 aa  167  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  46.94 
 
 		 238 aa  167  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  50.26 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  45.07 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  42.86 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  46.15 
 
 		 653 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  48.56 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  45.58 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.74 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  47.66 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>