More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2903 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  244  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  69.57 
 
 		 121 aa  172  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  63.33 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  63.33 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  65.18 
 
 		 120 aa  164  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  63.33 
 
 		 121 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  61.67 
 
 		 121 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  60 
 
 		 121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  60 
 
 		 121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  64.35 
 
 		 120 aa  160  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  60 
 
 		 121 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  60.83 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  61.67 
 
 		 120 aa  157  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  59.17 
 
 		 121 aa  156  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  63.56 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  54.17 
 
 		 121 aa  151  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  54.17 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  60.34 
 
 		 121 aa  147  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  53.78 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  54.31 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  59.17 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  49.58 
 
 		 120 aa  139  9e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  52.54 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  50.86 
 
 		 121 aa  137  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  52.59 
 
 		 121 aa  136  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  53.98 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  52.59 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  51.26 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  53.98 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  52.59 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  55.75 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  48.7 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  50 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  54.24 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  50.86 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  53.45 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  53.45 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  50.44 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  46.61 
 
 		 123 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  46.61 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  46.09 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 120 aa  113  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0512  response regulator PleD  45.69 
 
 		 456 aa  110  5e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 125 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 225 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.11 
 
 		 338 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.11 
 
 		 310 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 229 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 236 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 236 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 397 aa  104  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 232 aa  103  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 248 aa  103  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 232 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 230 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.82 
 
 		 356 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  39.32 
 
 		 457 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 123 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 227 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  38.46 
 
 		 457 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 230 aa  98.6  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.79 
 
 		 469 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 247 aa  99.4  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 227 aa  99.4  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  40.87 
 
 		 235 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 235 aa  98.6  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 229 aa  98.2  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 235 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  40.87 
 
 		 235 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  40.87 
 
 		 235 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  40.87 
 
 		 235 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  40.87 
 
 		 235 aa  97.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 367 aa  97.8  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 457 aa  98.2  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 414 aa  97.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  40.87 
 
 		 235 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>