More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1489 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
662 aa  1320    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  42.01 
 
 
645 aa  464  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  42.19 
 
 
705 aa  457  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  42.39 
 
 
656 aa  456  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  42.41 
 
 
680 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  41.2 
 
 
653 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  41.56 
 
 
645 aa  411  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  42.92 
 
 
661 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  35.36 
 
 
683 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  35.81 
 
 
732 aa  365  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  39.81 
 
 
668 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  35.66 
 
 
674 aa  359  9e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  37.67 
 
 
696 aa  356  5.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  39.9 
 
 
635 aa  348  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  33.78 
 
 
689 aa  348  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  35.37 
 
 
715 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  34.71 
 
 
715 aa  348  3e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  38.44 
 
 
681 aa  347  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  35.44 
 
 
715 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  36.96 
 
 
641 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  33.59 
 
 
667 aa  341  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  34.93 
 
 
680 aa  339  8e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  39.63 
 
 
662 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  38.89 
 
 
671 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  39.84 
 
 
649 aa  334  3e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  37.78 
 
 
767 aa  331  3e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  33.93 
 
 
709 aa  326  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  34.55 
 
 
707 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  37.65 
 
 
669 aa  323  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  35.09 
 
 
673 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  34.09 
 
 
734 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  35.03 
 
 
689 aa  320  6e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  33.95 
 
 
734 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  36.33 
 
 
767 aa  318  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  40.78 
 
 
672 aa  317  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  38.44 
 
 
674 aa  316  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  38.44 
 
 
674 aa  316  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  31.49 
 
 
691 aa  316  9e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  36.88 
 
 
673 aa  315  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  37.26 
 
 
684 aa  314  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  36.39 
 
 
688 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  35.42 
 
 
685 aa  311  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  35.42 
 
 
685 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  36.28 
 
 
688 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  36.78 
 
 
667 aa  310  4e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  35.62 
 
 
689 aa  310  6.999999999999999e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  33.19 
 
 
739 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  33.19 
 
 
739 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  37.76 
 
 
676 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  41.8 
 
 
943 aa  307  4.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  29.38 
 
 
662 aa  303  7.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  36.36 
 
 
676 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  36.47 
 
 
668 aa  297  4e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  36.99 
 
 
685 aa  297  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  31.42 
 
 
730 aa  293  7e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  35.02 
 
 
698 aa  291  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  29.38 
 
 
662 aa  289  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  31.15 
 
 
754 aa  280  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  30.66 
 
 
660 aa  279  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  35.91 
 
 
726 aa  275  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  30.2 
 
 
692 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  31.67 
 
 
687 aa  247  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  35.02 
 
 
706 aa  229  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  33.85 
 
 
633 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  28.18 
 
 
634 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  27.87 
 
 
644 aa  170  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  25.31 
 
 
631 aa  164  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  30.19 
 
 
644 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  29.13 
 
 
632 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  29.34 
 
 
632 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  26.42 
 
 
634 aa  145  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  20.51 
 
 
637 aa  144  6e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  25.91 
 
 
730 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  33.56 
 
 
639 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  23.34 
 
 
744 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  32.96 
 
 
737 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  37.65 
 
 
800 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  38.81 
 
 
760 aa  97.4  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  45.83 
 
 
788 aa  96.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  34.23 
 
 
706 aa  95.9  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  28.29 
 
 
790 aa  94  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  28.94 
 
 
681 aa  94  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  22.31 
 
 
742 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  27.6 
 
 
763 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  35.42 
 
 
800 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  25.99 
 
 
742 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  26.27 
 
 
742 aa  89.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  26.03 
 
 
742 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  30.35 
 
 
736 aa  89  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  26.27 
 
 
742 aa  89.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  34.23 
 
 
728 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  29.82 
 
 
886 aa  89  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  28.17 
 
 
742 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  26.15 
 
 
742 aa  88.2  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  26.01 
 
 
742 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  28.74 
 
 
730 aa  87.4  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  36.69 
 
 
720 aa  87.4  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  43.22 
 
 
764 aa  86.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  38.89 
 
 
673 aa  85.9  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  25.95 
 
 
742 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>