More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1072 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  100 
 
 		 393 aa  784    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  49.33 
 
 		 438 aa  336  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  53.96 
 
 		 452 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.09 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.41 
 
 		 388 aa  259  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  52.4 
 
 		 364 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  51.35 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  45.6 
 
 		 204 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.95 
 
 		 329 aa  105  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  44.29 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  34.95 
 
 		 317 aa  103  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  39.83 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  41.55 
 
 		 1048 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 180 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  40 
 
 		 388 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 340 aa  96.3  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  46.6 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  39.57 
 
 		 475 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  39.57 
 
 		 475 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  39.57 
 
 		 475 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  40 
 
 		 417 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  34.59 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  40.5 
 
 		 432 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  45.13 
 
 		 368 aa  93.6  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 257 aa  93.6  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  39.85 
 
 		 337 aa  93.2  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.34 
 
 		 332 aa  93.2  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  38.84 
 
 		 331 aa  93.2  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  36.46 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  40.85 
 
 		 225 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  34.13 
 
 		 429 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  39.71 
 
 		 467 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  39.71 
 
 		 467 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.4 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  37.04 
 
 		 472 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  42.06 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.81 
 
 		 337 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 327 aa  90.1  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 240 aa  90.1  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  37.66 
 
 		 467 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  47 
 
 		 302 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  45.19 
 
 		 378 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  34.67 
 
 		 235 aa  89.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  37.14 
 
 		 469 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  46.23 
 
 		 535 aa  89.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  38.68 
 
 		 337 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 256 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  47 
 
 		 199 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 333 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  45.19 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  31.89 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 411 aa  89  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 257 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 257 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  37.14 
 
 		 478 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 257 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  45 
 
 		 231 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 248 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  38.64 
 
 		 256 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  41.12 
 
 		 325 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  35.48 
 
 		 553 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  37.6 
 
 		 422 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  36.91 
 
 		 469 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 257 aa  87  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  31.98 
 
 		 394 aa  86.7  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 256 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  39.02 
 
 		 340 aa  86.7  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  44 
 
 		 400 aa  86.7  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 256 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 469 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  36.91 
 
 		 469 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  39.06 
 
 		 256 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  36.91 
 
 		 469 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  39.06 
 
 		 256 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 216 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  40.68 
 
 		 524 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 230 aa  85.9  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  41.12 
 
 		 259 aa  85.5  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.82 
 
 		 261 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 265 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0021  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 165 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  40.87 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  39.09 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  46 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 164 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.04 
 
 		 556 aa  84.7  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  36.24 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  36.49 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.22 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  37.1 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  42.71 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>