More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2974 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  48.87 
 
 		 1062 aa  745    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  43.46 
 
 		 1134 aa  692    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.19 
 
 		 1066 aa  710    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  62.4 
 
 		 1059 aa  1175    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  59.07 
 
 		 1044 aa  1109    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  59.96 
 
 		 1060 aa  1118    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  67.67 
 
 		 1051 aa  1308    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  48.51 
 
 		 1096 aa  739    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  46.6 
 
 		 1144 aa  746    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  44.98 
 
 		 1050 aa  700    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1074 aa  2075    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  44.82 
 
 		 1095 aa  693    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  44.34 
 
 		 1060 aa  646    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  41.47 
 
 		 1040 aa  642    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  42.2 
 
 		 1135 aa  628  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  42.98 
 
 		 1103 aa  585  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  38.9 
 
 		 1129 aa  549  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  41.5 
 
 		 1098 aa  549  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  37.34 
 
 		 1038 aa  539  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  38.26 
 
 		 1055 aa  535  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  40.43 
 
 		 1099 aa  532  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  38.67 
 
 		 1051 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  38.67 
 
 		 1051 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  38.1 
 
 		 1051 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  37.04 
 
 		 1038 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  38.34 
 
 		 1094 aa  510  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.45 
 
 		 1124 aa  498  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  39.02 
 
 		 1076 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  35.84 
 
 		 1115 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  36.04 
 
 		 1150 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  32.82 
 
 		 1059 aa  433  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.93 
 
 		 1145 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  37.42 
 
 		 1085 aa  386  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.56 
 
 		 1083 aa  382  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  37.44 
 
 		 1197 aa  350  7e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.73 
 
 		 1058 aa  332  3e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  22.85 
 
 		 946 aa  204  8e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  22.85 
 
 		 946 aa  204  8e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  29.53 
 
 		 707 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  31.3 
 
 		 1108 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  24.71 
 
 		 724 aa  197  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.11 
 
 		 737 aa  192  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.63 
 
 		 729 aa  192  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  33.21 
 
 		 1162 aa  191  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  24.15 
 
 		 731 aa  191  5e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 1144 aa  191  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  24.47 
 
 		 666 aa  188  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  31.26 
 
 		 1103 aa  188  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  32.25 
 
 		 1091 aa  184  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  24.28 
 
 		 735 aa  182  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  31.55 
 
 		 646 aa  177  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.36 
 
 		 762 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  28.61 
 
 		 739 aa  175  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.83 
 
 		 787 aa  175  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.71 
 
 		 785 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  27.57 
 
 		 790 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 743 aa  174  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.5 
 
 		 745 aa  173  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  29.37 
 
 		 787 aa  174  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.42 
 
 		 1019 aa  173  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.42 
 
 		 755 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  29.16 
 
 		 706 aa  173  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  28.52 
 
 		 846 aa  173  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  27.27 
 
 		 816 aa  172  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 786 aa  173  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.82 
 
 		 1111 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  28.38 
 
 		 787 aa  172  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  27.82 
 
 		 840 aa  172  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  28.38 
 
 		 787 aa  172  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0748  UvrD/REP helicase  27.35 
 
 		 653 aa  172  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00311747  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  27.76 
 
 		 787 aa  172  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  28.65 
 
 		 728 aa  172  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.28 
 
 		 726 aa  171  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.6 
 
 		 787 aa  171  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  30.77 
 
 		 1128 aa  171  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.97 
 
 		 763 aa  171  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.17 
 
 		 741 aa  171  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.62 
 
 		 892 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.68 
 
 		 671 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.4 
 
 		 765 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  30.49 
 
 		 671 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.35 
 
 		 786 aa  170  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.85 
 
 		 742 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.57 
 
 		 783 aa  168  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  30.36 
 
 		 671 aa  168  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  25.96 
 
 		 672 aa  168  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  27.18 
 
 		 783 aa  168  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  32.64 
 
 		 1162 aa  167  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.8 
 
 		 739 aa  167  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  27.62 
 
 		 728 aa  167  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.95 
 
 		 658 aa  167  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  28.38 
 
 		 688 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0209  UvrD/REP helicase  27.11 
 
 		 786 aa  166  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000644419  normal  0.953058 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  29.07 
 
 		 768 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  25.37 
 
 		 655 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.97 
 
 		 754 aa  165  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  30.63 
 
 		 682 aa  166  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  30.22 
 
 		 1041 aa  165  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  24.81 
 
 		 757 aa  165  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.72 
 
 		 788 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>