61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1087 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 436 aa  884    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  70.99 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  51.33 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  61.49 
 
 		 730 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  48.21 
 
 		 427 aa  360  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  48.65 
 
 		 456 aa  347  3e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  42.89 
 
 		 427 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  37.99 
 
 		 505 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  35.99 
 
 		 504 aa  221  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  37.89 
 
 		 498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  34.85 
 
 		 522 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  36.55 
 
 		 380 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  31.52 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  36.22 
 
 		 346 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  33 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  31.57 
 
 		 385 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  29.07 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  32.09 
 
 		 392 aa  167  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  37.93 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  35.37 
 
 		 317 aa  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  32.56 
 
 		 365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  37.1 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  28 
 
 		 991 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  37.75 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  34.16 
 
 		 335 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  28.75 
 
 		 462 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  29.72 
 
 		 554 aa  91.3  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  33.33 
 
 		 327 aa  89.7  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  30.67 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  28.97 
 
 		 375 aa  87.4  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  28.72 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  32.69 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  26.81 
 
 		 594 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  30.58 
 
 		 922 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  32.02 
 
 		 527 aa  79.7  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  27.66 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  29.93 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  29.26 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  28.25 
 
 		 512 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  30.99 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0280  AAA ATPase family protein  28.57 
 
 		 272 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  30.99 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  32.14 
 
 		 1409 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  28.62 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7394  Pectate lyase/Amb allergen  27.57 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0906839  normal  0.447007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  25.73 
 
 		 769 aa  67.8  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  28.42 
 
 		 375 aa  67  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  25.58 
 
 		 1316 aa  67  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  28.85 
 
 		 686 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  29.49 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  32.75 
 
 		 794 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  27.76 
 
 		 374 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  32.18 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  29.83 
 
 		 374 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  27.76 
 
 		 374 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  27.24 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  46.84 
 
 		 143 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  29.73 
 
 		 919 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  28.57 
 
 		 747 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3306  Pectate lyase/Amb allergen  23.81 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  24.65 
 
 		 314 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>