More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1045 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  100 
 
 		 740 aa  1442    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  68.56 
 
 		 750 aa  934    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  38.37 
 
 		 743 aa  466  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  40.27 
 
 		 761 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  39.97 
 
 		 743 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  39.05 
 
 		 732 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  40.3 
 
 		 723 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  37.86 
 
 		 842 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  35.39 
 
 		 717 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  35.83 
 
 		 735 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  37.7 
 
 		 755 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  37.13 
 
 		 728 aa  379  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  37.63 
 
 		 731 aa  379  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  38.58 
 
 		 723 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.39 
 
 		 796 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  36.05 
 
 		 735 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  36.72 
 
 		 718 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.69 
 
 		 735 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  34.71 
 
 		 752 aa  366  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  34.8 
 
 		 758 aa  365  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  35.57 
 
 		 734 aa  365  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  36.08 
 
 		 735 aa  365  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  37.22 
 
 		 832 aa  364  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  33.29 
 
 		 779 aa  362  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.24 
 
 		 729 aa  358  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  38.61 
 
 		 751 aa  354  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  36.18 
 
 		 737 aa  354  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  36.77 
 
 		 715 aa  352  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  37.55 
 
 		 876 aa  351  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  35.91 
 
 		 724 aa  346  8e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  29.04 
 
 		 829 aa  346  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  29.04 
 
 		 829 aa  346  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  30.03 
 
 		 893 aa  343  5e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  36.21 
 
 		 726 aa  339  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  34.21 
 
 		 732 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  33.2 
 
 		 760 aa  338  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  36.61 
 
 		 724 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  37.15 
 
 		 714 aa  337  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  35.1 
 
 		 793 aa  332  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  34.58 
 
 		 737 aa  331  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  35.24 
 
 		 734 aa  332  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  34.97 
 
 		 711 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  33.2 
 
 		 909 aa  327  3e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  33.71 
 
 		 917 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  36.36 
 
 		 781 aa  320  6e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  32.89 
 
 		 920 aa  318  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  29.86 
 
 		 704 aa  314  3.9999999999999997e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  32.19 
 
 		 742 aa  313  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  32.13 
 
 		 772 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  32.13 
 
 		 772 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  32.13 
 
 		 772 aa  312  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  32.57 
 
 		 779 aa  309  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  31.06 
 
 		 787 aa  308  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  32.58 
 
 		 758 aa  303  8.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  34.45 
 
 		 1002 aa  298  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  34.33 
 
 		 979 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  34.33 
 
 		 983 aa  294  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  32.56 
 
 		 749 aa  294  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  34.33 
 
 		 983 aa  294  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.82 
 
 		 746 aa  293  7e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  34.95 
 
 		 903 aa  290  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  32.04 
 
 		 787 aa  279  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.88 
 
 		 1382 aa  277  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  35.78 
 
 		 740 aa  277  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  32.48 
 
 		 734 aa  272  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  33.94 
 
 		 854 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  31.75 
 
 		 807 aa  271  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  31.99 
 
 		 734 aa  271  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  34.73 
 
 		 968 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  36.49 
 
 		 784 aa  266  7e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  35.89 
 
 		 978 aa  264  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  30.8 
 
 		 1058 aa  264  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  33.87 
 
 		 958 aa  263  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  30.47 
 
 		 743 aa  261  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  33.9 
 
 		 1092 aa  261  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  28.4 
 
 		 741 aa  260  7e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  34.11 
 
 		 710 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  34.68 
 
 		 966 aa  258  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  34.96 
 
 		 843 aa  257  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  35.71 
 
 		 738 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  33.2 
 
 		 729 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  30.38 
 
 		 791 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  33.02 
 
 		 726 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  32.84 
 
 		 732 aa  253  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  34.62 
 
 		 840 aa  253  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  32.3 
 
 		 731 aa  252  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  30.6 
 
 		 737 aa  247  6e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  45.62 
 
 		 776 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  33.43 
 
 		 903 aa  245  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.07 
 
 		 1095 aa  244  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.13 
 
 		 738 aa  244  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  31 
 
 		 733 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  28.94 
 
 		 846 aa  237  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  32.89 
 
 		 741 aa  236  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  29.08 
 
 		 730 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  29.08 
 
 		 730 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  32.54 
 
 		 766 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  31.96 
 
 		 758 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  30.25 
 
 		 805 aa  234  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  28.94 
 
 		 730 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>