60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1490 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  397  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  86.29 
 
 		 258 aa  327  5.0000000000000004e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  58.58 
 
 		 626 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  51.58 
 
 		 840 aa  167  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  49.5 
 
 		 400 aa  165  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  52.2 
 
 		 491 aa  155  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  48.77 
 
 		 403 aa  154  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  47.29 
 
 		 401 aa  149  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  45.09 
 
 		 528 aa  148  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  39.39 
 
 		 481 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  41.33 
 
 		 432 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  41.18 
 
 		 1131 aa  118  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  37.06 
 
 		 559 aa  117  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  45.81 
 
 		 629 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  37.06 
 
 		 553 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  40.83 
 
 		 404 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.69 
 
 		 769 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  34.86 
 
 		 417 aa  99.8  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  36 
 
 		 391 aa  94.7  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  36.31 
 
 		 408 aa  94.4  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  30.3 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  34.88 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  36.15 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  34.3 
 
 		 870 aa  76.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  30.23 
 
 		 708 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  36.05 
 
 		 940 aa  73.2  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  30.94 
 
 		 472 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  30.13 
 
 		 405 aa  67.8  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  29.33 
 
 		 477 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  33.56 
 
 		 538 aa  67  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  26.21 
 
 		 429 aa  67  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  29.83 
 
 		 382 aa  62  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  30.82 
 
 		 714 aa  60.5  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  28.47 
 
 		 917 aa  58.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1287 aa  58.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  33.51 
 
 		 938 aa  58.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  28.22 
 
 		 575 aa  56.2  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  31.69 
 
 		 3507 aa  55.1  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  35.09 
 
 		 1862 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  32.23 
 
 		 669 aa  51.6  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  28.03 
 
 		 430 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  29.19 
 
 		 1531 aa  49.3  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  27.75 
 
 		 603 aa  49.3  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  27.43 
 
 		 2068 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  30.23 
 
 		 387 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  31.85 
 
 		 1111 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  26.77 
 
 		 938 aa  47.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  30.34 
 
 		 696 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  26.92 
 
 		 501 aa  45.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  24.86 
 
 		 889 aa  44.7  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  33.04 
 
 		 456 aa  44.7  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  22.64 
 
 		 2864 aa  44.7  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  30.61 
 
 		 385 aa  44.3  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  34.45 
 
 		 439 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  28.36 
 
 		 2554 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0939  hypothetical protein  25.48 
 
 		 425 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0324617  normal  0.305646 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1755  hypothetical protein  28.1 
 
 		 529 aa  42.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  29.25 
 
 		 463 aa  41.6  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  31.2 
 
 		 688 aa  41.6  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  31.11 
 
 		 1848 aa  41.6  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>