More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2253 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2253  ABC transporter related  100 
 
 		 211 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6101  ABC transporter, ATPase subunit  60.77 
 
 		 214 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101171  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1834  ABC transporter related  60.77 
 
 		 214 aa  228  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1444  ABC transporter related  57.95 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3224  ABC transporter related  58.08 
 
 		 224 aa  214  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3276  ABC transporter related  51.94 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4044  ABC transporter related  55.29 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0974  ABC transporter related  47.85 
 
 		 208 aa  201  9e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2961  ABC transporter related  48.54 
 
 		 226 aa  197  9e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1271  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.481106  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2504  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 		 197 aa  182  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1691  ABC transporter related  50 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01791  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 212 aa  179  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02680  hypothetical protein  48.42 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2475  ABC transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003795  ABC transporter ATP-binding protein YnjD  47.89 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.260777  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01725  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  49.18 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1886  ABC transporter related protein  49.18 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01713  hypothetical protein  49.18 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1876  ABC transporter related  49.18 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1840  ABC transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1434  ABC transporter, ATP-binding protein  48.63 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2770  ABC transporter ATP-binding protein  44.67 
 
 		 213 aa  174  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154794  normal  0.0956097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2005  ABC transporter, ATP-binding protein  48.63 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1979  ABC transporter, ATP-binding protein  48.09 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.289049  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2155  ABC transporter-related protein  56.76 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000406105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2440  ABC transporter related  43.69 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0587803  normal  0.683858 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  44.19 
 
 		 329 aa  153  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.8 
 
 		 349 aa  151  7e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  44.26 
 
 		 363 aa  148  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  39.25 
 
 		 328 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  40.4 
 
 		 349 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  39.89 
 
 		 348 aa  145  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.38 
 
 		 343 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  41.38 
 
 		 343 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  43.72 
 
 		 347 aa  145  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.38 
 
 		 343 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  38.54 
 
 		 343 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 349 aa  144  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  40.53 
 
 		 348 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.58 
 
 		 349 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40.1 
 
 		 359 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  41.58 
 
 		 349 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  41.89 
 
 		 346 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  40.69 
 
 		 349 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.9 
 
 		 356 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  41.58 
 
 		 349 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  40 
 
 		 353 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.39 
 
 		 344 aa  142  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  41.58 
 
 		 349 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  40.1 
 
 		 329 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  42.62 
 
 		 342 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  42.86 
 
 		 351 aa  142  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  40.1 
 
 		 329 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  39.57 
 
 		 349 aa  142  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  41.58 
 
 		 349 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  42.22 
 
 		 330 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.39 
 
 		 340 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 		 346 aa  142  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  40.76 
 
 		 350 aa  141  6e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  37.07 
 
 		 348 aa  141  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.22 
 
 		 377 aa  141  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  40 
 
 		 352 aa  141  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2117  putative thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  40.1 
 
 		 329 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  40.1 
 
 		 329 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  38.97 
 
 		 354 aa  140  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.9 
 
 		 359 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  39.59 
 
 		 363 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  40.53 
 
 		 342 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  40.32 
 
 		 350 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  41.05 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  39.59 
 
 		 359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  41.54 
 
 		 366 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001684  thiamin ABC transporter ATPase component  42.63 
 
 		 234 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.79 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  41.05 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1099  ABC transporter related  41.05 
 
 		 349 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3810  thiamine transporter ATP-binding subunit  42.93 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0328  ABC transporter related  43.15 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0351  thiamine transport ATP-binding protein ThiQ  40.93 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  43.28 
 
 		 349 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  43.92 
 
 		 350 aa  139  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  42.64 
 
 		 356 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.02 
 
 		 408 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  39.47 
 
 		 349 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  36.71 
 
 		 353 aa  138  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  41.58 
 
 		 368 aa  138  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4355  ABC transporter related  42.93 
 
 		 342 aa  138  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  40.51 
 
 		 363 aa  138  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  40.22 
 
 		 356 aa  138  6e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  40.5 
 
 		 375 aa  138  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3109  ABC transporter ATP-binding protein  38.39 
 
 		 235 aa  138  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.41 
 
 		 363 aa  138  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 		 343 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  40.59 
 
 		 323 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  40.93 
 
 		 372 aa  137  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  41.8 
 
 		 336 aa  137  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  42.78 
 
 		 364 aa  137  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3261  ABC transporter ATP-binding protein  43.96 
 
 		 246 aa  137  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>