67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2616 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2616  WD40 repeat, subgroup  100 
 
 		 145 aa  293  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173979  normal  0.948356 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2728  hypothetical protein  40.98 
 
 		 384 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.402886 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2877  WD40 repeat, subgroup  40.31 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.01664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  43.84 
 
 		 1416 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  48.65 
 
 		 1557 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  38.82 
 
 		 1661 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  31.25 
 
 		 546 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  36 
 
 		 1163 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  48.61 
 
 		 460 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1789 aa  51.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.39 
 
 		 1240 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.48 
 
 		 1686 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  40 
 
 		 728 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  36.27 
 
 		 1176 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  36.62 
 
 		 1858 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  40.51 
 
 		 928 aa  47.4  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  40.91 
 
 		 954 aa  47  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  48.61 
 
 		 618 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  44.44 
 
 		 1523 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  42.86 
 
 		 742 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  41.03 
 
 		 2296 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  35 
 
 		 1901 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  39.36 
 
 		 1242 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  35.71 
 
 		 450 aa  44.3  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  41.67 
 
 		 696 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  32.86 
 
 		 1599 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  38.03 
 
 		 1177 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  26.85 
 
 		 1164 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  30.56 
 
 		 443 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.73 
 
 		 630 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.41 
 
 		 792 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  31.19 
 
 		 1236 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.68 
 
 		 1262 aa  42.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1290  Pyrrolo-quinoline quinone  37.65 
 
 		 442 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  36.23 
 
 		 1209 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.23 
 
 		 1363 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  46.15 
 
 		 831 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67807  F box protein, for ubiquitin- dependent degradation  40.28 
 
 		 780 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  34.25 
 
 		 322 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  34.57 
 
 		 1474 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.66 
 
 		 677 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1682 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  41.86 
 
 		 486 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05517  cell division control protein Cdc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13030)  44.29 
 
 		 1038 aa  41.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.181187 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.63 
 
 		 1868 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  34.25 
 
 		 322 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  35.62 
 
 		 324 aa  41.2  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  29.29 
 
 		 1161 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  31.37 
 
 		 1750 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  29.29 
 
 		 1161 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  40 
 
 		 963 aa  41.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  31.51 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  35.19 
 
 		 790 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  29.73 
 
 		 1213 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 505 aa  40.8  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  41.67 
 
 		 415 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  39.18 
 
 		 439 aa  40.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  36.9 
 
 		 1183 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.02 
 
 		 596 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  30.48 
 
 		 1552 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  38.24 
 
 		 1553 aa  40  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06359  Sulfur metabolite repression control protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00659]  35.71 
 
 		 678 aa  40  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  40 
 
 		 447 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  34.48 
 
 		 439 aa  40  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31 
 
 		 676 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  38.37 
 
 		 668 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06217  F-box and WD repeat-containing protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12060)  39.71 
 
 		 618 aa  40  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.824291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>