More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0971 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 590 aa  1214    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 585 aa  517  1.0000000000000001e-145  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 592 aa  479  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 597 aa  478  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 592 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 593 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 597 aa  466  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 621 aa  464  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 596 aa  457  1e-127  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 592 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 599 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 642 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 565 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 565 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 		 564 aa  313  7.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 		 566 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 		 563 aa  302  1e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 565 aa  294  2e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 		 562 aa  290  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 563 aa  288  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 562 aa  287  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 563 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 		 566 aa  284  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 564 aa  280  4e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 562 aa  279  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 		 624 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 562 aa  278  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 		 562 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 		 562 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 		 562 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 		 562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 562 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 566 aa  271  2.9999999999999997e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 		 562 aa  270  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  30.74 
 
 		 562 aa  269  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 		 574 aa  267  4e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 		 601 aa  265  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 565 aa  263  8e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 613 aa  246  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 640 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 566 aa  242  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 		 566 aa  242  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 569 aa  239  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 		 580 aa  237  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 566 aa  236  8e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 		 603 aa  234  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 550 aa  231  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 591 aa  228  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 		 567 aa  225  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 		 555 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  29.87 
 
 		 635 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 571 aa  212  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 572 aa  212  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 613 aa  211  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  28.39 
 
 		 650 aa  209  8e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 583 aa  209  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 591 aa  207  5e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 558 aa  207  6e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 569 aa  206  7e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 558 aa  204  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 595 aa  203  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 576 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5788  arginyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  27.7 
 
 		 622 aa  201  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 		 555 aa  200  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 		 578 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66750  arginyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 		 587 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 433 aa  197  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 559 aa  196  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 558 aa  195  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 		 581 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 		 581 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 		 579 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 		 581 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  25.7 
 
 		 581 aa  194  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 		 581 aa  192  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 581 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1274  arginyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 594 aa  191  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000144018  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 581 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 581 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 581 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  26.24 
 
 		 581 aa  190  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  25.04 
 
 		 581 aa  190  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 		 581 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 582 aa  189  9e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 		 581 aa  188  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 		 612 aa  187  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 581 aa  187  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0535  arginyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 		 579 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 		 578 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 		 578 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 578 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 635 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 630 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  27.86 
 
 		 577 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 576 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 581 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 		 598 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  26.41 
 
 		 578 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>