More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13224 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  67.85 
 
 		 1091 aa  1366    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  42.61 
 
 		 1128 aa  666    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  46.3 
 
 		 1162 aa  714    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  43.76 
 
 		 1108 aa  709    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  47.06 
 
 		 1144 aa  749    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.45 
 
 		 1090 aa  836    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 1101 aa  2162    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  42.11 
 
 		 1150 aa  661    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  43.89 
 
 		 1041 aa  657    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  43.39 
 
 		 1120 aa  636    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  52.16 
 
 		 1111 aa  949    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  50 
 
 		 1349 aa  702    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  69.32 
 
 		 1091 aa  1370    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  69 
 
 		 1091 aa  1368    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  69.32 
 
 		 1091 aa  1370    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  69.23 
 
 		 1086 aa  1299    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  46.88 
 
 		 1106 aa  746    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  51.65 
 
 		 1119 aa  965    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  41.79 
 
 		 1128 aa  627  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  42.71 
 
 		 1192 aa  627  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  40.99 
 
 		 1164 aa  610  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  43.81 
 
 		 1128 aa  606  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.42 
 
 		 1111 aa  600  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  39.33 
 
 		 1103 aa  596  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  41.79 
 
 		 1162 aa  598  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  39.46 
 
 		 1183 aa  581  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  41.86 
 
 		 1130 aa  578  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  39.53 
 
 		 1167 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  37.57 
 
 		 1073 aa  537  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  41.43 
 
 		 1088 aa  532  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  37 
 
 		 1176 aa  511  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.68 
 
 		 1094 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.43 
 
 		 1228 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  38.02 
 
 		 1136 aa  484  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.23 
 
 		 1119 aa  461  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  38.45 
 
 		 1124 aa  429  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  27.03 
 
 		 1343 aa  261  6e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  21.86 
 
 		 1016 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.79 
 
 		 785 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.79 
 
 		 785 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.94 
 
 		 762 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.77 
 
 		 784 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.17 
 
 		 775 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  26.99 
 
 		 768 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.5 
 
 		 639 aa  174  6.999999999999999e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  25.79 
 
 		 705 aa  172  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.93 
 
 		 729 aa  172  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  26.69 
 
 		 771 aa  173  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.02 
 
 		 858 aa  172  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.98 
 
 		 780 aa  172  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  22.76 
 
 		 639 aa  172  4e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.97 
 
 		 756 aa  171  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.5 
 
 		 1051 aa  171  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.55 
 
 		 794 aa  170  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  26.71 
 
 		 641 aa  169  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.77 
 
 		 773 aa  168  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  23.88 
 
 		 696 aa  169  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  24.04 
 
 		 1019 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.03 
 
 		 795 aa  168  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.39 
 
 		 694 aa  168  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  26.83 
 
 		 846 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  26.6 
 
 		 840 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  26.83 
 
 		 787 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  26.79 
 
 		 787 aa  165  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.25 
 
 		 772 aa  166  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.85 
 
 		 829 aa  166  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  28.25 
 
 		 659 aa  166  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.6 
 
 		 858 aa  165  4.0000000000000004e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  26.6 
 
 		 787 aa  164  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.63 
 
 		 786 aa  164  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  27.57 
 
 		 786 aa  164  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.51 
 
 		 787 aa  164  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  25.41 
 
 		 669 aa  163  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 		 700 aa  164  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.15 
 
 		 802 aa  163  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  23.76 
 
 		 743 aa  164  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  28.29 
 
 		 1044 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  30.35 
 
 		 1060 aa  163  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.41 
 
 		 838 aa  162  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27 
 
 		 831 aa  162  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.84 
 
 		 718 aa  161  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  25.32 
 
 		 736 aa  160  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.44 
 
 		 765 aa  160  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  29.43 
 
 		 1074 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 737 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.7 
 
 		 755 aa  159  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  26.01 
 
 		 723 aa  158  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  24.16 
 
 		 735 aa  158  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3138  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 		 689 aa  157  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.527942  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.47 
 
 		 828 aa  157  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  25.38 
 
 		 765 aa  156  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  21.85 
 
 		 731 aa  156  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.09 
 
 		 741 aa  156  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3865  UvrD/REP helicase  26.75 
 
 		 689 aa  155  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.322714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  25.99 
 
 		 744 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.16 
 
 		 713 aa  155  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  21.49 
 
 		 735 aa  155  4e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.88 
 
 		 741 aa  155  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.48 
 
 		 797 aa  155  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.57 
 
 		 730 aa  155  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>