More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1274 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  695    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  77.68 
 
 		 359 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  53.56 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  64.33 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  49.29 
 
 		 358 aa  352  4e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  50.43 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  41.23 
 
 		 347 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  41.42 
 
 		 347 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  44.44 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  41.69 
 
 		 347 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  39.83 
 
 		 340 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  38.62 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  41.46 
 
 		 382 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  42.22 
 
 		 344 aa  235  9e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  43.8 
 
 		 347 aa  229  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  41.23 
 
 		 345 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  40.95 
 
 		 345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  39.94 
 
 		 379 aa  215  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  39.49 
 
 		 372 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  38.33 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  34.75 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  34.93 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  35.69 
 
 		 344 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0581  protein of unknown function UPF0118  39.83 
 
 		 357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5210  protein of unknown function UPF0118  33.24 
 
 		 345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144016 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  32.63 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  29.24 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  30.9 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  31.18 
 
 		 340 aa  116  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  33.83 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  33.23 
 
 		 333 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  30.03 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  28.37 
 
 		 381 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  29.88 
 
 		 340 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  30.4 
 
 		 340 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  31.42 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  29.03 
 
 		 364 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  32.98 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  33.18 
 
 		 370 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  31.91 
 
 		 392 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  31.91 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  26.39 
 
 		 379 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  31.19 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  29.31 
 
 		 383 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  24.92 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  32.84 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  28.45 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  27.27 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  29.23 
 
 		 529 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  28.7 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  28.1 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  28.66 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.02 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  32.78 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  28.12 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  28.06 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  28.4 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  30.77 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.38 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  27.12 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  28.06 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  28.74 
 
 		 665 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  27.78 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  22.81 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  26.33 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  24.83 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  27.91 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  31.68 
 
 		 652 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  31.68 
 
 		 652 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  24.26 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  22.54 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  26.16 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  29.35 
 
 		 649 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  28.49 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  24.67 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.58 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  22.19 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  23.62 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  30.45 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  21.75 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  21.75 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  21.75 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  26.1 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05090  predicted permease  26.02 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.114877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  30.3 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  25.47 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  26.77 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  21.75 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  21.75 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  21.75 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  25.75 
 
 		 679 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  20.72 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  25.75 
 
 		 668 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  20.72 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  22.49 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  21.58 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  26.06 
 
 		 675 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  26.26 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  25.66 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>