More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0034 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0034  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 531 aa  1056    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0038  DEAD/DEAH box helicase-like  80.87 
 
 		 534 aa  824    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00371  superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family protein  68.89 
 
 		 542 aa  701    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46007  predicted protein  34.65 
 
 		 773 aa  251  3e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  29.15 
 
 		 906 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1520  SNF2-related:helicase, C-terminal  29.44 
 
 		 650 aa  123  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.254537  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  25.2 
 
 		 574 aa  120  7.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  24.79 
 
 		 1067 aa  114  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  25.17 
 
 		 1084 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4468  SNF2 family helicase  31.29 
 
 		 658 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59210  putative DNA helicase  31.29 
 
 		 657 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00046214  hitchhiker  0.000203412 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  26.1 
 
 		 1284 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  24.11 
 
 		 1084 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  27.02 
 
 		 1065 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  26.79 
 
 		 674 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  30.52 
 
 		 1096 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4822  helicase domain protein  29.58 
 
 		 726 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.59 
 
 		 1112 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27 
 
 		 1227 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  27.98 
 
 		 1086 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 		 1108 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.8 
 
 		 1110 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  27.03 
 
 		 1159 aa  107  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 		 1105 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 		 1082 aa  106  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  28.79 
 
 		 666 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  27.98 
 
 		 1449 aa  104  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  27.74 
 
 		 914 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18985  predicted protein  28.09 
 
 		 638 aa  103  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000565583  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  27.96 
 
 		 1141 aa  103  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  27.29 
 
 		 1080 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2686  helicase domain-containing protein  27.43 
 
 		 709 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.683306  normal  0.559781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  27.35 
 
 		 918 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  23.25 
 
 		 918 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  23.03 
 
 		 918 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  23.03 
 
 		 918 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  23.03 
 
 		 918 aa  101  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  27.37 
 
 		 1063 aa  101  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  23.03 
 
 		 918 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  23.03 
 
 		 918 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  23.03 
 
 		 918 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 		 617 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  23.03 
 
 		 918 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  26.12 
 
 		 1154 aa  100  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.11 
 
 		 1403 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  24.01 
 
 		 1185 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 		 1105 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  25.1 
 
 		 1087 aa  98.6  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  25.81 
 
 		 1386 aa  98.2  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 		 1102 aa  98.6  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  22.96 
 
 		 1175 aa  97.8  4e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 633 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  27.21 
 
 		 1070 aa  97.8  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  25.53 
 
 		 1099 aa  97.8  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  21.93 
 
 		 918 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  25.88 
 
 		 959 aa  97.4  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  29.59 
 
 		 1163 aa  97.1  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  24.15 
 
 		 964 aa  97.1  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  26.67 
 
 		 1025 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.73 
 
 		 1160 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.29 
 
 		 1113 aa  95.9  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  24.65 
 
 		 1362 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 		 1118 aa  95.9  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1088 aa  95.9  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  27.02 
 
 		 621 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  21.71 
 
 		 918 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  27.29 
 
 		 1113 aa  95.9  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.46 
 
 		 1139 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  29.21 
 
 		 985 aa  95.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1088 aa  94.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  27.69 
 
 		 1130 aa  93.6  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  27.91 
 
 		 872 aa  93.6  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  22.59 
 
 		 918 aa  93.6  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0956  SNF2-related  26.21 
 
 		 1075 aa  93.6  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0419207  unclonable  0.0000716871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  25.21 
 
 		 1134 aa  93.2  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  24.24 
 
 		 1354 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  24.31 
 
 		 1072 aa  93.2  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  27.59 
 
 		 777 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  25.71 
 
 		 1437 aa  93.2  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  29.19 
 
 		 991 aa  92.8  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  27.25 
 
 		 1161 aa  92.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  25.16 
 
 		 1019 aa  92  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  26.44 
 
 		 1381 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  22.2 
 
 		 891 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  27 
 
 		 1073 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  25.89 
 
 		 988 aa  91.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  26.1 
 
 		 1088 aa  91.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 		 876 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.06 
 
 		 1073 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  28.33 
 
 		 1357 aa  91.3  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  26.42 
 
 		 896 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  25.66 
 
 		 495 aa  90.1  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  23.99 
 
 		 1443 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  26.3 
 
 		 1073 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  27.4 
 
 		 1073 aa  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  28.84 
 
 		 1126 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  27.9 
 
 		 1120 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  28.34 
 
 		 1164 aa  90.1  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0843  SNF2 family helicase  26.32 
 
 		 1202 aa  89  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  27 
 
 		 1142 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>