More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2859 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  100 
 
 		 143 aa  295  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  73.43 
 
 		 143 aa  233  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  52.21 
 
 		 139 aa  154  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  46.32 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  46.81 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  47.79 
 
 		 139 aa  131  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2259  signal transduction protein  48.85 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0497964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  45.59 
 
 		 139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  44.85 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  47.41 
 
 		 138 aa  127  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  42.65 
 
 		 139 aa  127  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  45.93 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  47.41 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  46.67 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2431  signal transduction protein  44.44 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2685  signal transduction protein  42.22 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1766  signal transduction protein  44.44 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  45.19 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  44.44 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  44.44 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  44.44 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  43.7 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  43.7 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  42.96 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  42.96 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  42.96 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0256  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1253  CBS domain-containing protein  36.89 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  34.38 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  32.81 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  32.84 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  29.41 
 
 		 508 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  29.13 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  31.51 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  25 
 
 		 537 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  29.71 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  25.49 
 
 		 483 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  25 
 
 		 494 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  29.45 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  28.57 
 
 		 558 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.28 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  25.52 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  26.21 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  24.84 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  30.09 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  26.14 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  30.53 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  22.56 
 
 		 493 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  29.77 
 
 		 378 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.94 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.94 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  26.03 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  26.03 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  29.01 
 
 		 378 aa  57  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  30.33 
 
 		 862 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  23.81 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  28.15 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  27.45 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  33.05 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  25.2 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  25.62 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  25.55 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  26.03 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  24.83 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  30.15 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  29.77 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  27.89 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  30.37 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  33.68 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  23.97 
 
 		 491 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  25.81 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  25.17 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.86 
 
 		 483 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  24.11 
 
 		 426 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  26.56 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  27.14 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  26.32 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  26.32 
 
 		 246 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  30.89 
 
 		 597 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  25 
 
 		 483 aa  54.3  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  25.17 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1201  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.86 
 
 		 485 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.795344  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0664  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.86 
 
 		 485 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.116725  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  27.56 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  29.08 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1078  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.86 
 
 		 485 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.472537  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  24.39 
 
 		 300 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  29.46 
 
 		 698 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  24.49 
 
 		 428 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  24.32 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  28.37 
 
 		 226 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4744  thioesterase family protein  33.71 
 
 		 437 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4341  CBS domain-containing cytosolic protein  33.71 
 
 		 437 aa  52.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4353  CBS domain-containing cytosolic protein  33.71 
 
 		 437 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4858  thioesterase family protein  33.71 
 
 		 437 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  29.13 
 
 		 863 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>