More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4612 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  100 
 
 		 677 aa  1361    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  48.11 
 
 		 657 aa  545  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  38.77 
 
 		 658 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  44.43 
 
 		 695 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  38.76 
 
 		 533 aa  300  7e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  37.12 
 
 		 650 aa  296  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  37.69 
 
 		 635 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  35.63 
 
 		 661 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  36 
 
 		 674 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  34.13 
 
 		 633 aa  229  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  33.94 
 
 		 669 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  32.91 
 
 		 717 aa  213  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  33.04 
 
 		 778 aa  201  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  33.48 
 
 		 636 aa  200  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  29.18 
 
 		 662 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  29.06 
 
 		 637 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0784  beta-lactamase  28.51 
 
 		 638 aa  154  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4139  beta-lactamase  32.2 
 
 		 422 aa  143  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  32.74 
 
 		 601 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  29.91 
 
 		 513 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  32.06 
 
 		 595 aa  127  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  30.36 
 
 		 681 aa  127  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  31.51 
 
 		 421 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  31.51 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  32.27 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  30.49 
 
 		 580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  31.51 
 
 		 412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  31.91 
 
 		 413 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  31.91 
 
 		 422 aa  122  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  31.51 
 
 		 412 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  31.91 
 
 		 416 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  30.03 
 
 		 513 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  30.49 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  30.18 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  31.91 
 
 		 416 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  31.21 
 
 		 413 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3002  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  31.29 
 
 		 445 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  33.33 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  31.54 
 
 		 616 aa  115  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  25.41 
 
 		 588 aa  114  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.53 
 
 		 442 aa  114  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.38 
 
 		 497 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  30.12 
 
 		 404 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.98 
 
 		 392 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  30.4 
 
 		 498 aa  112  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  28.41 
 
 		 834 aa  111  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  31.44 
 
 		 285 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  29.87 
 
 		 447 aa  110  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  28.76 
 
 		 694 aa  110  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  30.45 
 
 		 476 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  28.61 
 
 		 691 aa  109  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  27.76 
 
 		 519 aa  109  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  32.07 
 
 		 507 aa  108  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  26.93 
 
 		 494 aa  108  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  30.82 
 
 		 713 aa  108  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  30.11 
 
 		 480 aa  107  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  27.43 
 
 		 405 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  27.64 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  28.32 
 
 		 359 aa  107  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  29.03 
 
 		 356 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  32.19 
 
 		 5698 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  31.43 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  27.64 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  30.29 
 
 		 530 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  27.64 
 
 		 485 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  27.64 
 
 		 485 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  28.94 
 
 		 691 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  28.94 
 
 		 691 aa  105  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  36 
 
 		 559 aa  104  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  28.45 
 
 		 359 aa  103  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  28.01 
 
 		 367 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  26.71 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  30.1 
 
 		 711 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  27.09 
 
 		 694 aa  102  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  28.48 
 
 		 691 aa  102  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  28.62 
 
 		 375 aa  102  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  27.72 
 
 		 377 aa  102  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  28.48 
 
 		 691 aa  102  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  27.24 
 
 		 485 aa  101  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  26.1 
 
 		 384 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.4 
 
 		 342 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  29.18 
 
 		 375 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  27.63 
 
 		 375 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  27.95 
 
 		 485 aa  101  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.19 
 
 		 487 aa  101  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  27.85 
 
 		 691 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  27.01 
 
 		 614 aa  100  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  28.62 
 
 		 459 aa  100  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  27.39 
 
 		 377 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  27.39 
 
 		 377 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  27.39 
 
 		 377 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  27.79 
 
 		 466 aa  100  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  31.12 
 
 		 694 aa  100  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  27.39 
 
 		 375 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  28.25 
 
 		 450 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  27.84 
 
 		 410 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  25.93 
 
 		 353 aa  99.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.5 
 
 		 493 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  27.39 
 
 		 377 aa  99  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>