150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1147 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1147  molecular chaperone (small heat shock protein)-like protein  100 
 
 		 196 aa  387  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467431  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3753  hypothetical protein  59.06 
 
 		 135 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3173  molecular chaperone (small heat shock protein)-like protein  52.71 
 
 		 133 aa  143  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5718  molecular chaperone (small heat shock protein)-like protein  38.89 
 
 		 134 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0871  heat shock protein, Hsp20 family  40.91 
 
 		 134 aa  99.8  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0996  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 		 134 aa  99.8  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000618844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3005  hypothetical protein  42.52 
 
 		 134 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  37.89 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  34.17 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  36.44 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  29.01 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  35.9 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  32.88 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  31.18 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  34.57 
 
 		 145 aa  57  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  31.06 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  32.26 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  31.18 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  31.96 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  30 
 
 		 143 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  32.72 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  31.18 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  32.72 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  32 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  27.88 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 150 aa  52  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  31 
 
 		 144 aa  51.6  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 		 156 aa  51.2  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1175  heat shock protein Hsp20  32.32 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  27.52 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  25 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  25 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  36.46 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  29.73 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  26.04 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  31.31 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  32.5 
 
 		 152 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  26.27 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  25 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  30.95 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  34.15 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  29.63 
 
 		 152 aa  48.9  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  32 
 
 		 143 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  29.2 
 
 		 169 aa  48.5  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 		 152 aa  48.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1268  heat shock protein Hsp20  32.73 
 
 		 148 aa  48.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.972795  normal  0.261941 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  29.01 
 
 		 141 aa  48.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 142 aa  48.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1100  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 		 150 aa  48.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000430897  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 		 148 aa  47.8  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  29.55 
 
 		 145 aa  47.8  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  32.99 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  31.4 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  31.4 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  24.41 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  24.41 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  26.45 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  31.71 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  26.92 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  26.8 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  30.95 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1533  heat shock protein Hsp20  24.3 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.207706  normal  0.208575 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1559  heat shock protein Hsp20  31.68 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0277974  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  27.43 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  27.91 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1354  heat shock protein Hsp20  29.71 
 
 		 134 aa  46.2  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0222398  normal  0.226114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  27.13 
 
 		 147 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  30.85 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 		 148 aa  45.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  27.45 
 
 		 146 aa  45.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  27.45 
 
 		 146 aa  45.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1806  heat shock protein Hsp20  24.27 
 
 		 139 aa  45.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332989  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  29.46 
 
 		 147 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  32.2 
 
 		 144 aa  45.1  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  25.53 
 
 		 162 aa  45.4  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  29.75 
 
 		 147 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  25.81 
 
 		 147 aa  45.1  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  29.75 
 
 		 147 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>