284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1995 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  100 
 
 		 215 aa  433  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0310  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  53.99 
 
 		 222 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1941  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  58.38 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139802  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  56.45 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  52.36 
 
 		 219 aa  214  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6763  HAD family hydrolase  57.37 
 
 		 216 aa  211  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  55.68 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2155  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  50 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  51.38 
 
 		 217 aa  204  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  55.14 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  50.68 
 
 		 219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  48.34 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  50.79 
 
 		 220 aa  188  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0396  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  46.88 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3204  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.26 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  40.95 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1946  hypothetical protein  65.22 
 
 		 70 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.185313  normal  0.213914 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  28.36 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  27.8 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  37.98 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  30.04 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  28.47 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  28.47 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  30.77 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.69 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  24.3 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  31.73 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.1 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  30.77 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  31.73 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  23.94 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.4 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  37.74 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  28.71 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  35.29 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  27.67 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  32.29 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  26.96 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.16 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  28.23 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  28.45 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  26.15 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  34.43 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  26.61 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  32.65 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  27.03 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  37.19 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  27.03 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.37 
 
 		 268 aa  52  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  26.64 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  27.67 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  38.74 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  30.69 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  26.81 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  30.28 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  29.68 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.67 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  33.61 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.26 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  32.74 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.79 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  32.74 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  28.79 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  29.52 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  34.21 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.43 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  21.99 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2255  HAD family hydrolase  39.24 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  0.797248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  25.76 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  21.99 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  29.05 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  29.36 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  29.36 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  25.97 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  26.41 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.35 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  25.26 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.11 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1888  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  48 
 
 		 286 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.772314  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.12 
 
 		 260 aa  49.7  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2294  HAD superfamily hydrolase  26.28 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  26.2 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  28.68 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  25.89 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  31.06 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2373  HAD family hydrolase  40.51 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  28.71 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  27.54 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  32 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>