More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0012 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 249 aa  501  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  43.48 
 
 		 261 aa  191  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  39.83 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  37.02 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  39.2 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 251 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 267 aa  175  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  40.8 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  38.14 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 254 aa  168  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  37.5 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  32.66 
 
 		 252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  37.83 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  34.35 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  36.82 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  36.86 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  36.36 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  34.8 
 
 		 259 aa  141  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  34.01 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 258 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  31.98 
 
 		 259 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  33.8 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  31.3 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  35.15 
 
 		 248 aa  128  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  31.23 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  35.98 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  35.46 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  35.93 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1427  DeoR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.847076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  33.61 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 264 aa  121  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  34.78 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  32.17 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  32.23 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.02 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  31.64 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  33.07 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  32.76 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  30.21 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  30.67 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  29.13 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  31.43 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  31.93 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  29.74 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 376 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.6 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  27.95 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  29.63 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  29.63 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  31 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  29.63 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  29.63 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  28.39 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  29.63 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  29.36 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  29.36 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  29.36 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  29.36 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>