More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0266 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 715 aa  1446    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.92 
 
 		 700 aa  832    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.57 
 
 		 739 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  37.5 
 
 		 712 aa  463  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  37.08 
 
 		 729 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.3 
 
 		 706 aa  451  1e-125  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.16 
 
 		 756 aa  446  1e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.44 
 
 		 791 aa  437  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  36.62 
 
 		 799 aa  439  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.38 
 
 		 710 aa  436  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  35.58 
 
 		 723 aa  436  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.88 
 
 		 708 aa  435  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.62 
 
 		 709 aa  426  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  34.56 
 
 		 727 aa  420  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.09 
 
 		 729 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  34.26 
 
 		 726 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.13 
 
 		 694 aa  411  1e-113  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  33.91 
 
 		 808 aa  411  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  35.29 
 
 		 693 aa  412  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.22 
 
 		 799 aa  411  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  35.44 
 
 		 760 aa  405  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.09 
 
 		 751 aa  382  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.3 
 
 		 747 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.7 
 
 		 747 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.67 
 
 		 746 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.27 
 
 		 707 aa  350  5e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.38 
 
 		 707 aa  347  5e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.76 
 
 		 707 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  36.55 
 
 		 824 aa  329  1.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.34 
 
 		 662 aa  293  9e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.64 
 
 		 988 aa  238  4e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.38 
 
 		 1265 aa  220  7e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.91 
 
 		 780 aa  209  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.85 
 
 		 1004 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.03 
 
 		 803 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.59 
 
 		 807 aa  194  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.64 
 
 		 785 aa  194  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.71 
 
 		 1004 aa  191  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  31.79 
 
 		 2015 aa  190  9e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.66 
 
 		 800 aa  188  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  31.81 
 
 		 1942 aa  183  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  31.45 
 
 		 1767 aa  182  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.05 
 
 		 811 aa  180  7e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.69 
 
 		 811 aa  180  8e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  33.26 
 
 		 2208 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.74 
 
 		 810 aa  179  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.02 
 
 		 816 aa  178  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.6 
 
 		 820 aa  177  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  33.17 
 
 		 2157 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  30.3 
 
 		 2152 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.55 
 
 		 1230 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.05 
 
 		 811 aa  169  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.87 
 
 		 952 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  28.29 
 
 		 2189 aa  166  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  31.03 
 
 		 2111 aa  164  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  32.67 
 
 		 908 aa  161  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  33.5 
 
 		 893 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  25.07 
 
 		 874 aa  159  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  28.71 
 
 		 825 aa  158  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  28.33 
 
 		 1589 aa  158  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  30.57 
 
 		 1055 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  32.51 
 
 		 908 aa  157  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  28.07 
 
 		 1710 aa  157  8e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  30.24 
 
 		 908 aa  157  8e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.16 
 
 		 1318 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  32.51 
 
 		 908 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.62 
 
 		 825 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  27.59 
 
 		 901 aa  154  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.33 
 
 		 762 aa  154  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  28.73 
 
 		 863 aa  153  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  32.01 
 
 		 1060 aa  152  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  33.33 
 
 		 890 aa  152  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  28.97 
 
 		 924 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  28.28 
 
 		 926 aa  148  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  31.16 
 
 		 905 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  29.47 
 
 		 906 aa  148  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  26.76 
 
 		 903 aa  149  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  28.6 
 
 		 924 aa  147  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.13 
 
 		 817 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  28.04 
 
 		 924 aa  147  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.03 
 
 		 927 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  30.2 
 
 		 919 aa  146  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  27.79 
 
 		 927 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  30.48 
 
 		 889 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  27.93 
 
 		 1073 aa  145  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.84 
 
 		 996 aa  144  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  27.58 
 
 		 1068 aa  143  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.36 
 
 		 815 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  30.32 
 
 		 701 aa  141  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  28.19 
 
 		 1068 aa  142  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  28.43 
 
 		 933 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  29.9 
 
 		 402 aa  140  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  28.15 
 
 		 904 aa  140  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  27.52 
 
 		 909 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.27 
 
 		 657 aa  139  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.04 
 
 		 688 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  27.33 
 
 		 998 aa  139  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  30.16 
 
 		 1465 aa  138  4e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  26.28 
 
 		 872 aa  136  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.27 
 
 		 917 aa  136  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>