More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4483 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  54.48 
 
 		 706 aa  775    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 712 aa  1459    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  72.05 
 
 		 690 aa  1039    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  70.8 
 
 		 706 aa  1052    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  62.08 
 
 		 697 aa  933    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  70.93 
 
 		 702 aa  1042    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  70.24 
 
 		 706 aa  1047    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  83.75 
 
 		 712 aa  1223    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  84.9 
 
 		 710 aa  1258    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  71.23 
 
 		 703 aa  1061    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  70.1 
 
 		 701 aa  1033    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  70.8 
 
 		 706 aa  1053    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  71.59 
 
 		 709 aa  1056    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  71.45 
 
 		 709 aa  1053    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  70.86 
 
 		 697 aa  1042    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  83.52 
 
 		 714 aa  1217    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06761  hypothetical protein  44.23 
 
 		 690 aa  570  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000849  putative ferrichrome-iron receptor  42.7 
 
 		 699 aa  547  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.744816  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  42.04 
 
 		 693 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  39.31 
 
 		 693 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  31 
 
 		 710 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 		 770 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 		 710 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  30.38 
 
 		 749 aa  228  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 748 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 		 738 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 748 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  30.57 
 
 		 740 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 737 aa  220  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 742 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 742 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 708 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 860 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 726 aa  212  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 743 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 850 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 707 aa  209  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 711 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 719 aa  205  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 738 aa  204  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.11 
 
 		 709 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 706 aa  203  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 706 aa  203  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 708 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 689 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.7 
 
 		 708 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 721 aa  201  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 715 aa  200  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 743 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 732 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 743 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 736 aa  198  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 731 aa  198  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 694 aa  198  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 710 aa  197  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.65 
 
 		 711 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 817 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 747 aa  196  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 743 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 743 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.04 
 
 		 703 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 714 aa  194  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 751 aa  194  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 825 aa  194  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 743 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 743 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.92 
 
 		 724 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 712 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 712 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 825 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 743 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 731 aa  191  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 796 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 734 aa  190  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  27.77 
 
 		 724 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 815 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 730 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  26.65 
 
 		 796 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  26.15 
 
 		 743 aa  189  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 791 aa  188  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 726 aa  188  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 731 aa  188  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 731 aa  188  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 726 aa  187  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 730 aa  187  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 710 aa  187  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 796 aa  187  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 730 aa  187  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 837 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  26.92 
 
 		 715 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 792 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 705 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 862 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  26.29 
 
 		 791 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 712 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 730 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 779 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 796 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 729 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 		 710 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>