More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3295 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3295  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 		 459 aa  956    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3442  Fmu (Sun) domain-containing protein  70.28 
 
 		 460 aa  669    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2960  Fmu (Sun) domain-containing protein  60.49 
 
 		 449 aa  580  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1415  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.98 
 
 		 453 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.41 
 
 		 457 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.972179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1376  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.76 
 
 		 453 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2967  Fmu (Sun) domain protein  59.11 
 
 		 463 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30363  normal  0.0477993 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2867  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.41 
 
 		 469 aa  551  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1392  Fmu (Sun) domain-containing protein  59.11 
 
 		 453 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2697  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.19 
 
 		 457 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199062 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1209  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.67 
 
 		 458 aa  545  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1575  NOL1/NOP2/sun family putative RNA methylase  58.71 
 
 		 486 aa  544  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1305  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.54 
 
 		 463 aa  544  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2739  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.08 
 
 		 475 aa  526  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438417  hitchhiker  0.0000842018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2643  Fmu (Sun)  56.38 
 
 		 464 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1086  Fmu (Sun)  47.36 
 
 		 454 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3846  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.65 
 
 		 451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  29.55 
 
 		 416 aa  177  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  29.38 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  29.38 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  29.38 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  29.38 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  29.38 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  29.38 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  30.07 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  29.38 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.3 
 
 		 465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.14 
 
 		 421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  30.14 
 
 		 421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.14 
 
 		 421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.13 
 
 		 478 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  30.21 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  29 
 
 		 421 aa  163  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  31.16 
 
 		 447 aa  163  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  31.23 
 
 		 416 aa  161  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  31.32 
 
 		 410 aa  159  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  28.47 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  28.01 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  29.17 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  30.26 
 
 		 519 aa  158  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.77 
 
 		 420 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.16 
 
 		 419 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.77 
 
 		 420 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.45 
 
 		 421 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  28.1 
 
 		 465 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  28 
 
 		 465 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28.97 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  27.94 
 
 		 419 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.06 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  37.23 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  28.64 
 
 		 419 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  35.23 
 
 		 466 aa  146  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.18 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  26.77 
 
 		 424 aa  144  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  36.32 
 
 		 425 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.5 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  28.79 
 
 		 403 aa  140  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  27.9 
 
 		 434 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.21 
 
 		 425 aa  140  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  26.94 
 
 		 425 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2091  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.11 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  37.08 
 
 		 460 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.75 
 
 		 449 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  28.25 
 
 		 454 aa  137  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.22 
 
 		 404 aa  136  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  30.23 
 
 		 435 aa  136  9e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  27.74 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.06 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  32.3 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  35.04 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  26.81 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  36.56 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  28.16 
 
 		 429 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  28.3 
 
 		 428 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  28.75 
 
 		 428 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  29.11 
 
 		 429 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.07 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  28.8 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  25.97 
 
 		 423 aa  132  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.42 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  29.63 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  29.63 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  28.71 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  31.27 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  26.73 
 
 		 417 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  28.8 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.36 
 
 		 429 aa  130  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  30.5 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  33.19 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  29.57 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  31.16 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  35.56 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  28.12 
 
 		 428 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  30.48 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  30.48 
 
 		 444 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  30.29 
 
 		 452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.04 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  29.02 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  27.81 
 
 		 428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0995  Fmu (Sun) domain protein  27.49 
 
 		 387 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.788221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>