143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1356 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  100 
 
 		 173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  78.41 
 
 		 180 aa  291  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  69.19 
 
 		 172 aa  254  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  67.61 
 
 		 178 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  65.7 
 
 		 172 aa  246  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  64.53 
 
 		 180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  60.82 
 
 		 205 aa  233  7e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  61.99 
 
 		 176 aa  233  9e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  63.95 
 
 		 172 aa  231  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  60.45 
 
 		 177 aa  227  7e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  59.66 
 
 		 180 aa  224  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  59.66 
 
 		 180 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  59.66 
 
 		 176 aa  224  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  59.66 
 
 		 176 aa  223  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  57.95 
 
 		 176 aa  214  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0536  MutT/nudix family protein  56.4 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  56.82 
 
 		 176 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 		 176 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  57.06 
 
 		 187 aa  210  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  55.68 
 
 		 176 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  57.95 
 
 		 182 aa  207  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  52.33 
 
 		 177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  52.33 
 
 		 175 aa  191  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  39.22 
 
 		 171 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  38.56 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1651  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.07 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057152  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 145 aa  47.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2945  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.39 
 
 		 172 aa  47.4  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.019417  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  45.24 
 
 		 314 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 314 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1331  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.8 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 237 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3008  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1021  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.39 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000480643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3043  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.39 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2865  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.39 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000404837  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2947  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.39 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000622219  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1038  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.39 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1142  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.39 
 
 		 174 aa  44.7  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000333704  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0668  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.44 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1227  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.39 
 
 		 173 aa  44.3  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000249848  hitchhiker  0.00278569 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3129  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.39 
 
 		 174 aa  44.3  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000022986  normal  0.998128 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0863  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.39 
 
 		 178 aa  44.3  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1184  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.39 
 
 		 174 aa  44.3  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515571  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1228  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.39 
 
 		 174 aa  44.3  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1261  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.39 
 
 		 174 aa  44.3  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000399476  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2965  mutT/nudix family protein  25.53 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223919  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 341 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0263  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.1 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0510399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0072  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0502  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  36.21 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0414588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 301 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1132  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.99 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000912913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  29.5 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1378  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000389327  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  35.59 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  29.5 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  29.5 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  29.5 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 322 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2782  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.99 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000489466  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  40.32 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0746  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.98 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00235884 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.89 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0169  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.72 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 304 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1920  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.234524  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0684  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.24 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2888  NUDIX hydrolase  26.36 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 303 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0609  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.24 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26314  predicted protein  32 
 
 		 243 aa  42.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3248  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00145388  normal  0.225138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  35.82 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1119  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.22 
 
 		 162 aa  42  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1924  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 		 148 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2060  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 		 148 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0210595  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2071  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 		 148 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0582  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 		 134 aa  42  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0569  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.89 
 
 		 170 aa  42  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 132 aa  42  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 134 aa  42  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>