81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5713 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  100 
 
 		 292 aa  578  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  50.18 
 
 		 283 aa  238  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  42.07 
 
 		 320 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  40.14 
 
 		 305 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2988  Beta-lactamase class A-like protein  38.2 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  31.72 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  28.82 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1458  beta-lactamase  28.72 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3960  hypothetical protein  29.02 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3301  beta-lactamase  29.97 
 
 		 304 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  26.72 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  30.89 
 
 		 576 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  25 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  24.31 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  28.33 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  38.21 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  24.37 
 
 		 803 aa  66.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  28 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  23.98 
 
 		 442 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  28.05 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  22.83 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1291  beta-lactamase, putative  35.25 
 
 		 387 aa  57  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  23.67 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3839  Beta-lactamase class A-like  30.77 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  23.94 
 
 		 504 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  26.37 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6760  Beta-lactamase class A-like protein  38.61 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5574  Beta-lactamase class A-like protein  38 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.57 
 
 		 422 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  33.04 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  28.72 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  25.27 
 
 		 425 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  35.42 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  32.2 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  25 
 
 		 424 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  34 
 
 		 454 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1760  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.81 
 
 		 363 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  24.91 
 
 		 425 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1569  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.24 
 
 		 363 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  28.47 
 
 		 418 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  23.23 
 
 		 375 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  34.04 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0174  Beta-lactamase  28.12 
 
 		 388 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1090  putative beta-lactamase  35.23 
 
 		 443 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1743  hypothetical protein  22.44 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1617  hypothetical protein  22.44 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.482442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1578  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.82 
 
 		 363 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128652  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  24.79 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2225  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  22.17 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0645654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1793  hypothetical protein  24.82 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3583  hypothetical protein  25.42 
 
 		 363 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  31.87 
 
 		 443 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1874  hypothetical protein  26.27 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3253  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  23.83 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.309405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  31.87 
 
 		 443 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  31.87 
 
 		 443 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  23.6 
 
 		 440 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1820  hypothetical protein  25.42 
 
 		 363 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.549767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1618  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.27 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  31.91 
 
 		 458 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  24.45 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1476  hypothetical protein  25.35 
 
 		 496 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1460  Beta-lactamase  29.33 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3565  hypothetical protein  23.37 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3658  hypothetical protein  23.37 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  22.33 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  22.33 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  23.6 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  35.16 
 
 		 452 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1402  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  23.28 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  33.75 
 
 		 424 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  22.09 
 
 		 468 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3558  hypothetical protein  23.91 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000125985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  24.18 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3605  hypothetical protein  23.91 
 
 		 359 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0681619  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3259  hypothetical protein  23.91 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3309  hypothetical protein  23.91 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0370218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3344  hypothetical protein  23.91 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3568  hypothetical protein  22.83 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  25.7 
 
 		 297 aa  42.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1659  hypothetical protein  23.37 
 
 		 369 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000949854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>