More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4991 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  100 
 
 
388 aa  764    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  60.16 
 
 
387 aa  431  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  40.67 
 
 
391 aa  242  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  42.11 
 
 
393 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  36.34 
 
 
380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  37.23 
 
 
398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  35.1 
 
 
406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31650  transcriptional regulator/sugar kinase  34.35 
 
 
374 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  30.17 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  33 
 
 
420 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.53 
 
 
418 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3299  ROK family protein  36.83 
 
 
428 aa  125  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233562  normal  0.194548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  31.98 
 
 
392 aa  122  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  30.71 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  29.47 
 
 
401 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3042  ROK family protein  32.74 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  29.93 
 
 
404 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  30.19 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  28.69 
 
 
393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.27 
 
 
395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  31.23 
 
 
416 aa  116  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  31.81 
 
 
391 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  32.14 
 
 
386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  28.81 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  26.58 
 
 
409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  31.44 
 
 
392 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3599  ROK family protein  34.44 
 
 
402 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  31.74 
 
 
404 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  27.07 
 
 
396 aa  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  29.06 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  22.97 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  29.29 
 
 
408 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.72 
 
 
389 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1925  ROK family protein  26.45 
 
 
388 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.300813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  31.73 
 
 
399 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  30.08 
 
 
396 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.79 
 
 
386 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  30.96 
 
 
403 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  31.86 
 
 
403 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  31.35 
 
 
417 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  21.05 
 
 
408 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  26.48 
 
 
397 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  32.33 
 
 
391 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  29.49 
 
 
398 aa  106  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  26.43 
 
 
322 aa  106  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  23.96 
 
 
407 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  30.59 
 
 
390 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  27.94 
 
 
402 aa  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  29.5 
 
 
396 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  32.47 
 
 
401 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  30.17 
 
 
401 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  32.08 
 
 
398 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  29.2 
 
 
404 aa  103  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1078  ROK family protein  29.41 
 
 
318 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  28.8 
 
 
397 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  30.81 
 
 
403 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  32.85 
 
 
434 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  28.96 
 
 
289 aa  101  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  32.46 
 
 
457 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  26.39 
 
 
435 aa  100  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  31.19 
 
 
393 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  21.66 
 
 
396 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  27.84 
 
 
410 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  29.62 
 
 
422 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  37.02 
 
 
302 aa  99.8  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  26.33 
 
 
402 aa  99.4  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  26.82 
 
 
295 aa  99.4  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  29.2 
 
 
392 aa  99  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  26.97 
 
 
410 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  28.12 
 
 
327 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  28.12 
 
 
327 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  28.12 
 
 
327 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  28.12 
 
 
327 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  28.12 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  28.12 
 
 
327 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  24.2 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  24.27 
 
 
315 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  24.27 
 
 
315 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  28.12 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  28.12 
 
 
327 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2018  ROK family protein  31.73 
 
 
391 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812225  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  28.12 
 
 
327 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  28.92 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  29.25 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  23.79 
 
 
396 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  29.1 
 
 
311 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  27.97 
 
 
427 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  27.07 
 
 
393 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  31.75 
 
 
413 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  30.38 
 
 
418 aa  97.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  27.81 
 
 
327 aa  97.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  24.27 
 
 
378 aa  97.1  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  26.44 
 
 
295 aa  96.7  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  25.81 
 
 
399 aa  96.7  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  26.3 
 
 
420 aa  96.3  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  28.43 
 
 
327 aa  96.3  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1741  ROK family protein  31.18 
 
 
392 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00402921  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  27.95 
 
 
390 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  27.87 
 
 
392 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  24.35 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>