More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4413 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  100 
 
 		 244 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  64.44 
 
 		 252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  61.86 
 
 		 243 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  64.66 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  62.71 
 
 		 245 aa  282  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  60.67 
 
 		 269 aa  280  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  59.58 
 
 		 279 aa  275  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  63.56 
 
 		 277 aa  275  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  54.78 
 
 		 455 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  55.04 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  54.24 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  55.51 
 
 		 253 aa  248  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  53.36 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  52.79 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  58.05 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  56.22 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  51.05 
 
 		 252 aa  245  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  56.36 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  54.63 
 
 		 445 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  54.74 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  57.2 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  50 
 
 		 255 aa  242  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  52.84 
 
 		 264 aa  241  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  51.85 
 
 		 262 aa  241  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  53.48 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  53.91 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.32 
 
 		 269 aa  239  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.08 
 
 		 280 aa  239  4e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  53.59 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  52.16 
 
 		 255 aa  238  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  53.39 
 
 		 271 aa  238  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  53.25 
 
 		 261 aa  237  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  56.52 
 
 		 258 aa  237  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  56.9 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  56.56 
 
 		 268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  48.07 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  51.65 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  51.63 
 
 		 258 aa  232  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.22 
 
 		 264 aa  231  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  58.75 
 
 		 249 aa  230  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  52.19 
 
 		 266 aa  229  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  53.48 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.64 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  53.74 
 
 		 272 aa  228  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  58.7 
 
 		 257 aa  228  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  54.19 
 
 		 277 aa  228  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  51.69 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  48.55 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  50.67 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  55.71 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  51.34 
 
 		 271 aa  226  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  51.3 
 
 		 288 aa  225  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  50 
 
 		 253 aa  225  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  49.58 
 
 		 277 aa  225  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  49.79 
 
 		 293 aa  222  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  53.36 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  53.85 
 
 		 248 aa  221  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  51.98 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  48.32 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  54.13 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  52.44 
 
 		 247 aa  211  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  54.13 
 
 		 245 aa  209  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.88 
 
 		 245 aa  209  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  53.65 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  45.08 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  48.95 
 
 		 255 aa  204  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2588  ABC transporter related  49.54 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0206492  hitchhiker  0.00398644 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  43.62 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  48.86 
 
 		 302 aa  202  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  44.5 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.14 
 
 		 228 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 		 279 aa  201  7e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0684  ABC transporter related  42.34 
 
 		 253 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0699  ABC transporter related  42.34 
 
 		 253 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  51.07 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44.29 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  45.33 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0314  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 		 253 aa  197  7.999999999999999e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.924183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  46.7 
 
 		 653 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  43.61 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  43.52 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  44.44 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  46.15 
 
 		 565 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  42.15 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  42.15 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  44.5 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  50.22 
 
 		 245 aa  194  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  44.49 
 
 		 236 aa  194  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  41.22 
 
 		 259 aa  194  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.05 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  41.35 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  46.26 
 
 		 563 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  47.47 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  43.23 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  45.95 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  45.95 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  44.5 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>