117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2284 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  100 
 
 		 425 aa  867    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  50.5 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  50.74 
 
 		 652 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  50.12 
 
 		 559 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  47.75 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  46.9 
 
 		 451 aa  348  7e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  46.35 
 
 		 414 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  44.8 
 
 		 521 aa  320  3.9999999999999996e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  45.14 
 
 		 854 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  43.63 
 
 		 762 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  41.63 
 
 		 703 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  41.25 
 
 		 439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  41.4 
 
 		 455 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  41.4 
 
 		 472 aa  280  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  40.31 
 
 		 586 aa  260  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  37.04 
 
 		 675 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  36.51 
 
 		 763 aa  249  6e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  34.7 
 
 		 484 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  34.33 
 
 		 674 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  33.33 
 
 		 639 aa  209  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  37.53 
 
 		 662 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  35.71 
 
 		 536 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  37.34 
 
 		 540 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  36.06 
 
 		 532 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  36.2 
 
 		 542 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  33.26 
 
 		 674 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  37.08 
 
 		 540 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  36.09 
 
 		 651 aa  203  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  36.06 
 
 		 539 aa  202  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  32.52 
 
 		 674 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  32.74 
 
 		 674 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  32.74 
 
 		 674 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  32.52 
 
 		 674 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  33.02 
 
 		 674 aa  200  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  33.02 
 
 		 674 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  33.02 
 
 		 674 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  33.02 
 
 		 674 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  32.17 
 
 		 674 aa  199  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  31.29 
 
 		 482 aa  193  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  34.62 
 
 		 792 aa  193  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  32.72 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  30.86 
 
 		 1271 aa  187  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  30.87 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  31.44 
 
 		 505 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  31.92 
 
 		 463 aa  173  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  34.16 
 
 		 382 aa  172  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  30.65 
 
 		 869 aa  170  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  30.29 
 
 		 652 aa  169  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  31.29 
 
 		 867 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  34.18 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  31.15 
 
 		 868 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  31.36 
 
 		 868 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  31.36 
 
 		 868 aa  166  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  31.37 
 
 		 868 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  30.93 
 
 		 868 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  33.43 
 
 		 377 aa  163  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1080 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  35.1 
 
 		 373 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  31.35 
 
 		 388 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  29.41 
 
 		 396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  31.33 
 
 		 863 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  30.28 
 
 		 868 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  32.12 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  29.09 
 
 		 848 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  29.17 
 
 		 563 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  28.09 
 
 		 972 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.76 
 
 		 1578 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  30.45 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  28.54 
 
 		 848 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  28.13 
 
 		 499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  26.01 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  27.63 
 
 		 855 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  29.74 
 
 		 1362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  26.46 
 
 		 431 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  30.19 
 
 		 563 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  27.37 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 		 1129 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  26 
 
 		 634 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 		 1127 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 		 1127 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  26.27 
 
 		 657 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  27.75 
 
 		 1127 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  27.2 
 
 		 1127 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  25.98 
 
 		 1146 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  27.27 
 
 		 861 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  29.12 
 
 		 772 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  26.81 
 
 		 760 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  26.72 
 
 		 699 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  27.93 
 
 		 1053 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  26.72 
 
 		 699 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  26.72 
 
 		 699 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 		 426 aa  100  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  29.22 
 
 		 1051 aa  99.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  26.46 
 
 		 699 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  27.1 
 
 		 1054 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  24.74 
 
 		 855 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  26.13 
 
 		 699 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  25.94 
 
 		 1782 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  26.57 
 
 		 827 aa  95.1  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 		 904 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>