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for query gene Spro_4800 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4800  multidrug resistance protein D  100 
 
 		 394 aa  780    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0030  multidrug/H+ antiporter, major facilitator superfamily (MFS)  73.11 
 
 		 383 aa  528  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4245  multidrug resistance protein D  71.57 
 
 		 394 aa  530  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4024  multidrug resistance protein D  73.1 
 
 		 394 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4079  multidrug resistance protein D  73.1 
 
 		 394 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4129  multidrug resistance protein D  74.01 
 
 		 386 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.771712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4187  multidrug resistance protein D  73.74 
 
 		 394 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4008  multidrug resistance protein D  73.74 
 
 		 386 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5105  multidrug resistance protein D  72.08 
 
 		 396 aa  522  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.336287 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4181  multidrug resistance protein D  72.08 
 
 		 394 aa  521  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03557  multidrug efflux system protein  72.08 
 
 		 394 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03500  hypothetical protein  72.08 
 
 		 394 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4039  multidrug resistance protein D  72.08 
 
 		 394 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679822 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0027  multidrug resistance protein D  72.08 
 
 		 394 aa  521  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3886  multidrug resistance protein D  72.08 
 
 		 394 aa  521  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0023  multidrug resistance protein D  71.7 
 
 		 394 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  43.7 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  46.59 
 
 		 400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  44.94 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  43.59 
 
 		 401 aa  293  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2267  multidrug resistance protein D  44.42 
 
 		 410 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0513916  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  44.42 
 
 		 410 aa  292  9e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  44.68 
 
 		 410 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2329  multidrug resistance protein D  43.18 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000177786  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  43.13 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  43.59 
 
 		 414 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  43.11 
 
 		 422 aa  282  9e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1936  multidrug resistance protein D  43.37 
 
 		 414 aa  279  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2040  multidrug resistance protein D  43.26 
 
 		 414 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.139954 
 
 
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NC_004347  SO_2389  multidrug resistance protein D  44.02 
 
 		 414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_1989  multidrug resistance protein D  43.4 
 
 		 414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209754 
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.5 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  31.21 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.1 
 
 		 394 aa  153  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  31.66 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  31.5 
 
 		 394 aa  144  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.25 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  29.57 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.94 
 
 		 405 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.22 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  29.1 
 
 		 387 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  28.53 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  28.53 
 
 		 407 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  28.64 
 
 		 397 aa  135  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.77 
 
 		 410 aa  135  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.12 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.05 
 
 		 458 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.24 
 
 		 405 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.24 
 
 		 405 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  29.7 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.34 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.38 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.1 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.64 
 
 		 409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5459  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.19 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.243673  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1763  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.29 
 
 		 407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599795  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.74 
 
 		 465 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.37 
 
 		 469 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.72 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.43 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.25 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.5 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  28.61 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 399 aa  123  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04810  Xaa-His dipeptidase  29.87 
 
 		 394 aa  122  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.75 
 
 		 396 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.93 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.62 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.1 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.16 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.39 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.23 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.17 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.46 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.67 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  26.52 
 
 		 420 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  1 
 
 
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NC_013457  VEA_001081  multidrug resistance protein D  35.65 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.92 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.06 
 
 		 412 aa  119  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.97 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.2 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.12 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.62 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101918 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.5 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_1144  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.23 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  33.79 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.28 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.28 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0763382 
 
 
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NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.28 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.28 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  26.42 
 
 		 414 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.22 
 
 		 416 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
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