277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2075 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2075  beta-lactamase  100 
 
 		 511 aa  1046    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3988  beta-lactamase  55.29 
 
 		 503 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0140  beta-lactamase  53.89 
 
 		 503 aa  528  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.877778  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3736  beta-lactamase  48.8 
 
 		 502 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5915  penicillin binding protein  46.25 
 
 		 502 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  26.55 
 
 		 543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  24.11 
 
 		 559 aa  109  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  24.13 
 
 		 543 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  24.13 
 
 		 543 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  24.52 
 
 		 537 aa  100  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  26.05 
 
 		 364 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  25 
 
 		 462 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  22.51 
 
 		 477 aa  90.5  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.74 
 
 		 364 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  22.65 
 
 		 351 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  27.38 
 
 		 371 aa  87  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  27.9 
 
 		 356 aa  86.7  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  25.61 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  26.19 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  24.71 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  25 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1412  D-aminopeptidase  24.02 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  27.07 
 
 		 482 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  25.61 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3981  D-aminopeptidase  23.45 
 
 		 516 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3246  D-aminopeptidase  23.1 
 
 		 516 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.01 
 
 		 498 aa  77.8  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  24.31 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  24.2 
 
 		 487 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  21.67 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.32 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  24.8 
 
 		 493 aa  73.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  24.92 
 
 		 443 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  25.68 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  24.59 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0947  D-aminopeptidase  23.21 
 
 		 518 aa  72.4  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  25.13 
 
 		 637 aa  71.2  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0889  D-aminopeptidase  23.62 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.66 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  23.77 
 
 		 848 aa  70.9  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.65 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  28.19 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  23.5 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  28.36 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  21.94 
 
 		 578 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  21.74 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  23.22 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  24.84 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  24.65 
 
 		 486 aa  67  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  25.81 
 
 		 412 aa  67  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.55 
 
 		 388 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  24.51 
 
 		 388 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.28 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  24.52 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  24.52 
 
 		 388 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  24.52 
 
 		 389 aa  66.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  24.52 
 
 		 388 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  23.19 
 
 		 513 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  26.25 
 
 		 445 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.64 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  26.67 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  23.17 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.94 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0563  beta-lactamase  25.68 
 
 		 506 aa  65.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000636485 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  25.35 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  26.28 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  27.33 
 
 		 711 aa  64.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3874  beta-lactamase  22.26 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  25.59 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  24.35 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  25.89 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  25.18 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  25.18 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  25.18 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  25.99 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.18 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  25.63 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  24.53 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  25.72 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.09 
 
 		 385 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  20.54 
 
 		 431 aa  63.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  28.26 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  28.48 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.72 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.72 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  24.61 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.92 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  23.18 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1263  beta-lactamase  28.9 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0172767 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  23.88 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  25 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  21.67 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.08 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  26.32 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  26.21 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2105  beta-lactamase  21.55 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  22.73 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  23.35 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  23.82 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  26.67 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>