108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4182 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  100 
 
 		 192 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  55.74 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  55.62 
 
 		 226 aa  164  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  50 
 
 		 220 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  51.55 
 
 		 163 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  49.43 
 
 		 222 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  50.63 
 
 		 202 aa  144  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  50.6 
 
 		 338 aa  143  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  46.82 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  47.06 
 
 		 179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  46.67 
 
 		 254 aa  134  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  49.69 
 
 		 191 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  43.29 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  47.02 
 
 		 184 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  50.63 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  43.98 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  49.68 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  44.81 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  51.15 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  43.04 
 
 		 357 aa  121  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  48.7 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  44.51 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  44.51 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  43.9 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  41.07 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  44.85 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  48.91 
 
 		 137 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  45.39 
 
 		 216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  41.61 
 
 		 160 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  41.72 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  43.6 
 
 		 257 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  35.95 
 
 		 253 aa  99.4  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  40 
 
 		 217 aa  98.2  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  37.8 
 
 		 170 aa  90.5  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  33.93 
 
 		 229 aa  89  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  36.14 
 
 		 227 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  33.82 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  40.18 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  35.96 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  30.67 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  28.76 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  30.14 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  37.75 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  34.97 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  34.04 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  34.04 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  31.25 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  32.37 
 
 		 269 aa  67.8  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  36.05 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  32.81 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  31.51 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  31.76 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  35.23 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  25.48 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  30.19 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  33.85 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  31.11 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  25.83 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  28.18 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  23.68 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  24.83 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  24.83 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2558  hypothetical protein  35.53 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  25.36 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  33.58 
 
 		 149 aa  53.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  22.08 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  26.38 
 
 		 156 aa  52.4  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  33.56 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  33.08 
 
 		 154 aa  51.6  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  31.39 
 
 		 160 aa  51.6  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  26.56 
 
 		 270 aa  51.2  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  25 
 
 		 264 aa  50.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  32.65 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  26.75 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  28.28 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  32.61 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  34.04 
 
 		 161 aa  49.7  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  29.22 
 
 		 160 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  24.65 
 
 		 159 aa  48.9  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0422  recombination regulator RecX  24.63 
 
 		 258 aa  48.9  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3614  regulatory protein RecX  35.09 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0968404  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  21.8 
 
 		 271 aa  48.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  23.27 
 
 		 267 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  26.09 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  32.85 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  24.03 
 
 		 163 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10730  hypothetical protein  27.91 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0103312  unclonable  0.00000000098721 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  25 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  27.66 
 
 		 151 aa  45.1  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  44.7  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 270 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>